Это приложение для Linux под названием TagGraph, последний выпуск которого можно загрузить как WindowsDockerTG.1.8.1.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение TagGraph с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
ТегГрафик
ОПИСАНИЕ
Хотя масс-спектрометрия хорошо подходит для идентификации тысяч потенциальных посттрансляционных модификаций белков (ПТМ), исторически она была склонна лишь к нескольким. Чтобы измерить весь набор PTM в различных протеомах, программное обеспечение должно преодолеть двойную задачу: покрыть огромные пространства поиска и отличить правильную интерпретацию спектра от неправильной. Здесь мы описываем TagGraph, вычислительный инструмент, который преодолевает обе проблемы с помощью метода неограниченного поиска по строкам, который в 350 раз быстрее существующих подходов, и вероятностной модели проверки, которую мы оптимизировали для назначений PTM. Мы применили TagGraph к опубликованному набору протеомных данных человека из 25 миллионов масс-спектров и утроили достоверность идентификации спектра по сравнению с исходным анализом. Мы идентифицировали тысячи типов модификаций почти на 1 миллионе сайтов протеома.Особенности
- Определение сложных протеомов с помощью строки
Аудитория
Обучение
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/taggraph/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.