Это приложение для Linux под названием UniPyRange для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как UniPyRangeSuite.py. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием UniPyRange, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
UniPyRange для работы в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Очень простой скрипт на Python, который избавит вас от необходимости подсчета аминокислот / оснований ДНК в файлах fasta из Uniprot и NCBI RefSeq Database (1, 2).Допустим, вам нужна аминокислотная последовательность диапазона 128-387 из 1000 аминокислотного белка - этот сценарий поможет вам избежать ошибок подсчета, просто показывая вам указанную последовательность в аминокислотах и кодирующих пары оснований ДНК (идеально для разработки праймера для амплификации. ) указанного идентификатора Uniprot ID.
- Требуется BioPython (3) и пакет биосервисов (4)
(1)
Консорциум UniProt
UniProt: центр информации о белках
Нуклеиновые Кислоты Res. 43: Д204-Д212 (2015).
(2)
RefSeq: обновление референсных последовательностей млекопитающих. Nucleic Acids Res. 2014 1 января; 42 (1): D756-63.
(3)
Cock PJ et al. Биоинформатика (2009)
(4)
Кокелаер и др., Биоинформатика (2013 г.)
Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
