Это приложение для Windows с именем MANTI.pl / muda.pl для запуска в Windows через Интернет через Linux в Интернете, последнюю версию которого можно загрузить как muda.pl-v3.6.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MANTI.pl / muda.pl, чтобы бесплатно запускать его в Windows через Интернет в Linux через OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
MANTI.pl / muda.pl для запуска в Windows онлайн через Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
-------- ВНИМАНИЕ НАЧАЛО: ПЕРЕИМЕНОВАНИЕmuda.pl был переименован в MANTI.pl с v3.7, развитие проекта можно отслеживать на странице проекта MANTI на sourceforge.net. Старые версии остаются здесь для архивных целей.
-------- ВНИМАНИЕ КОНЕЦ
muda.pl - это оценочный скрипт (написанный на Perl) без особых зависимостей.
Он объединяет информацию из 4 различных выходных файлов MaxQuant в главный файл, специально предназначенный для анализа неоконцеваний белков. Центральным якорем для совокупности данных является файл modifySpecificPeptides.txt - дополнительные данные берутся из других исходных файлов из папки MaxQuant txt, но отправной точкой для сборки данных является только файл modifySpecificPeptides.txt. Может быть, также полезен для нормальных целей протеомики, но этот сценарий сильно оптимизирован для идентификации и проверки неокончаний белков.
Для более подробного объяснения параметров скрипта и стратегии оценки, пожалуйста, обратитесь к обширному руководству в формате PDF.
Особенности
- Оценка данных MaxQuant
- Идентификация и валидация белков-концевиков
- Аннотации и сборка данных UniProt
- Повторное сопоставление идентифицированных Термини с изоформами
- Интеграция Limma, LOCALIZER и TopFINDer
- Хорошо документированы
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Perl
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/muda/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
