Это приложение для Windows под названием Scaffold_Builder, последний выпуск которого можно загрузить как scaffold_builder_v2.2.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Scaffold_Builder с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
Строительные леса
ОПИСАНИЕ
Scaffold_builder - это программное обеспечение для упорядочивания контигов, сгенерированных черновым секвенированием по эталонной последовательности. Промежутки заполняются буквами N, а небольшие перекрытия согласовываются с алгоритмом Нидлмана – Вунша и консенсусом, достигнутым с помощью кодов IUPAC. Scaffold_builder может помочь в сборке и аннотации геномов, обнаруживая, чего не хватает, и позволяя целенаправленное секвенирование, чтобы закрыть эти пробелы.(c) Сильва Г.Г., Дютиль Б.Е., Мэтьюз Т.Д., Элкинс К., Шмидер Р., Динсдейл Е.А., Эдвардс Р.А.
Цитируйте: «Объединение de novo и сборки на основе справочников с помощью Scaffold_builder», Исходный код для биологии и медицины, 2013 г.
Особенности
- эшафот
- черновик генома
- биоинформатики
Интерфейс пользователя
Веб-интерфейс, командная строка
Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
