นี่คือคำสั่ง bp_local_taxonomydb_queryp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bp_local_taxonomydb_query - ค้นหา TaxonomyDB ในพื้นที่สำหรับสายพันธุ์หรือtaxonid
DESCRIPTION
สคริปต์นี้แสดงตัวอย่างการใช้งานการเข้าถึงฐานข้อมูลอนุกรมวิธานในพื้นที่
นำไปใช้กับ Berkeley DB (จำเป็นต้องมีโมดูล DB_File)
การใช้งาน:
bp_local_taxonomydb_query.PLS: [-v] --nodes nodes.dmp --names names.dmp "Genus1 species1" "Genus2 species2"
จัดเตรียมไฟล์ nodes.dmp และ names.dmp จากดัมพ์อนุกรมวิธาน NCBI (ดู
Bio::DB::Taxonomy::flatfile สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม) จำเป็นเฉพาะในการรันครั้งแรกเท่านั้น
การดำเนินการนี้จะสร้างดัชนีในเครื่องและอาจใช้เวลานาน อย่างไรก็ตาม เมื่อสร้างแล้ว
ดัชนีเหล่านี้จะช่วยให้เข้าถึงรหัสอนุกรมวิธานหรือรหัสอนุกรมวิธานไปยังชื่อสปีชีส์ได้อย่างรวดเร็ว
การค้นหา
ใช้ bp_local_taxonomydb_queryp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net