นี่คือคำสั่ง bp_make_mrna_proteinp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bp_make_mrna_protein - แปลงลำดับอินพุต mRNA/cDNA เป็นโปรตีน
DESCRIPTION
แปลงลำดับ mRNA/cDNA อินพุตเป็นโปรตีนโดยใช้ แปลภาษา()
-f/--frame ระบุเฟรม [0,1,2]
นอกจากนี้ยังสามารถระบุ:
-t/--terminator หยุดอักขระ Codon (ค่าเริ่มต้นเป็น '*')
-u/--ไม่ทราบอักขระโปรตีนที่ไม่รู้จัก (ค่าเริ่มต้นเป็น 'X')
-cds/--fullcds คาดว่าจะเป็น CDS เต็มรูปแบบ (พร้อม start และ Stop codon)
-throwOnError เกิดข้อผิดพลาดหากไม่มีซีดีแบบเต็ม (ค่าเริ่มต้นเป็น 0)
-if/--format รูปแบบอินพุต (ค่าเริ่มต้นเป็น FASTA/Pearson)
-of/--รูปแบบ รูปแบบเอาต์พุต (ค่าเริ่มต้นเป็น FASTA/Pearson)
-o/-output ชื่อไฟล์เอาต์พุต (ค่าเริ่มต้นเป็น STDOUT)
-i/-อินพุตชื่อไฟล์อินพุต (ค่าเริ่มต้นเป็น STDIN)
-ct/--codontable ตาราง Codon ที่จะใช้ (ค่าเริ่มต้นคือ '1')
ดู Bio::PrimarySeq สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับตาราง codon และ แปลภาษา() วิธี
ผู้แต่ง - เจสัน สตาจิช
อีเมล jason-at-bioperl-dot-org
ใช้ bp_make_mrna_proteinp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
