นี่คือคำสั่ง bp_split_seqp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bp_split_seq - แบ่งลำดับเป็นชิ้นขนาดเท่ากันด้วยตัวเลือก
ช่วงที่ทับซ้อนกัน
เรื่องย่อ
bp_split_seq -c 10000 [-o 1000] [-i] -f seq.in
DESCRIPTION
สคริปต์จะแบ่งลำดับเป็นชิ้น ๆ
ตัวเลือกบังคับ:
-c ความยาวที่ต้องการของลำดับผลลัพธ์
-f ไฟล์อินพุต (ต้องเป็นรูปแบบ FASTA)
ตัวเลือกพิเศษ:
-o ช่วงที่ทับซ้อนกันระหว่างลำดับผลลัพธ์
-i สร้างไฟล์ดัชนีด้วยไฟล์ลำดับที่เป็นผลลัพธ์ นี่คือ
มีประโยชน์ถ้าคุณต้องการส่งรายการนี้เป็นอาร์กิวเมนต์อินพุตลงใน
โปรแกรมอื่น (เช่น CLUSTAL, HMMER เป็นต้น)
การตอบรับ
จดหมาย รายการ
ความคิดเห็นของผู้ใช้เป็นส่วนสำคัญของวิวัฒนาการของโมดูลนี้และโมดูล Bioperl อื่นๆ ส่ง
ข้อคิดเห็นและข้อเสนอแนะของคุณ ควรไปที่รายชื่อผู้รับจดหมายของ Bioperl การมีส่วนร่วมของคุณ
เป็นที่ชื่นชมมาก
[ป้องกันอีเมล] - พูดคุยเรื่องทั่วไป
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - เกี่ยวกับรายชื่อผู้รับจดหมาย
การรายงาน Bugs
รายงานจุดบกพร่องไปยังระบบติดตามจุดบกพร่องของ Bioperl เพื่อช่วยเราติดตามจุดบกพร่องและข้อบกพร่องเหล่านั้น
ปณิธาน. สามารถส่งรายงานข้อบกพร่องผ่านทางเว็บ:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
ผู้เขียน
Ewan Birney E birney-at-ebi.ac.ukE
เมาริซิโอ เอร์เรร่า กัวดรา เอ เมาริซิโอที่ open-bio.orgE
(ปรับปรุงบางส่วน)
ใช้ bp_split_seqp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
