cmtk-dwi_mask_bad_slices - ออนไลน์ใน Cloud

โครงการ:

ชื่อ

dwi_mask_bad_slices - ค้นหาส่วนที่ไม่ถูกต้องในชุดรูปภาพที่ถ่วงน้ำหนักแบบกระจาย

เรื่องย่อ

dwi_mask_bad_slices เส้นทางการแพร่กระจายภาพ

DESCRIPTION

เครื่องมือนี้จะอ่านชุดรูปภาพ MR ที่ถ่วงน้ำหนักแบบกระจาย 3 มิติ และค้นหาชิ้นส่วนที่ไม่ถูกต้อง ชิ้นที่ไม่ดี
ในภาพที่แพร่จะถูกตรวจพบว่าเป็นภาพที่ความเข้มเฉลี่ยอยู่นอกค่าที่กำหนด
ช่วงเวลารอบค่าเฉลี่ยของค่าเฉลี่ยของชิ้นส่วนที่เกี่ยวข้องทั้งหมดจากส่วนที่เหลือ
ภาพการแพร่กระจาย

OPTIONS

เหตุการณ์ที่ Toolkit Options (เหล่านี้ เป็น ที่ใช้ร่วมกัน by ทั้งหมด ซี.เอ็ม.ที.เค เครื่องมือ)
--ช่วยด้วย
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน

-- ช่วยทั้งหมด
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานและขั้นสูงทั้งหมดลงในเอาต์พุตมาตรฐาน

--วิกิ
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งไปยังเอาต์พุตมาตรฐานในมาร์กอัปมีเดียวิกิ

--ชาย
เขียนแหล่งที่มาของหน้าคนในมาร์กอัป 'nroff' ไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน

--รุ่น
เขียนเวอร์ชันชุดเครื่องมือไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน

--เสียงสะท้อน
เขียนบรรทัดคำสั่งปัจจุบันไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน

--verbose-ระดับ
กำหนดระดับการใช้คำฟุ่มเฟือย

--รายละเอียด, -v
เพิ่มระดับการใช้คำฟุ่มเฟือยขึ้น 1 (เลิกใช้แล้ว รองรับความเข้ากันได้แบบย้อนหลัง)

--กระทู้
ตั้งค่าจำนวนเธรดแบบขนานสูงสุด (สำหรับเธรด POSIX และ OpenMP)

อินพุต Options
--b0นับ
จำนวน b=0 ภาพที่จุดเริ่มต้นของรายการรูปภาพ สิ่งเหล่านี้ไม่รวมอยู่ใน
การตรวจจับสไลซ์หรือการมาสก์ที่ไม่ดี แต่ยังถูกเขียนไปยังไดเร็กทอรีเอาต์พุตสำหรับ
ความสะดวก. สันนิษฐานว่ารูปภาพ b=0 ทั้งหมดอยู่ที่จุดเริ่มต้นของรายการ
ป้อนรูปภาพ แต่ไม่ใช่ตอนท้ายหรือตรงกลาง [ค่าเริ่มต้น: 0]

--slice-ปฐมนิเทศ
กำหนดการวางแนวสไลซ์ของรูปภาพแบบกระจาย ค่าที่รองรับ: "แกน",
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z" โดยค่าเริ่มต้นคือ "axial"
หรือใช้อย่างใดอย่างหนึ่งต่อไปนี้:

--แกน
ชิ้นแกน [นี้ is ค่าเริ่มต้น]

--ทัล
ชิ้นทัล

--โคโรนา
ชิ้นโคโรล

--ชิ้น-x
แกนพิกัด X คือทิศทางของสไลซ์

--slice-ย
แกนพิกัด Y คือทิศทางของสไลซ์

--ชิ้น-z
แกนพิกัด Z คือทิศทางของสไลซ์ [นี้ is ค่าเริ่มต้น]

ไม่ดี ชิ้น การตรวจพบ
--stdev
เกณฑ์สำหรับการระบุชิ้นที่ไม่ถูกต้องในหน่วยของค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานความเข้มข้นมากกว่า
ชิ้นส่วนที่เกี่ยวข้องทั้งหมดจากภาพกระจายที่เหลือ [ค่าเริ่มต้น: 3]

เอาท์พุต Options
--เปลี่ยนเป็น
ชนิดข้อมูลสเกลาร์สำหรับรูปภาพที่ส่งออก หากค่าช่องว่างภายในของคุณเป็นค่าลบ แต่ค่าของคุณ
ป้อนข้อมูลที่ไม่ได้ลงนามเช่นตรวจสอบให้แน่ใจว่าได้เลือกประเภทข้อมูลที่ลงนามสำหรับ
เอาท์พุท โดยค่าเริ่มต้น ชนิดข้อมูลผลลัพธ์จะเหมือนกับชนิดข้อมูลเข้า ได้รับการสนับสนุน
ค่า: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" หรือใช้
หนึ่งในสิ่งต่อไปนี้:

--ถ่าน
8 บิต, ลงนาม

--ไบต์
8 บิต, ไม่ได้ลงนาม

--สั้น
16 บิต, ลงนาม

--ushort
16 บิต, ไม่ได้ลงนาม

--int
ลงนาม 32 บิต

--uint
ไม่ได้ลงนาม 32 บิต

--ลอย
จุดลอยตัว 32 บิต

--สองเท่า
จุดลอยตัว 64 บิต

--padding-ค่า , -p
ค่าแพดดิ้งเพื่อแทนที่ข้อมูลของสไลซ์เสียที่ตรวจพบในอิมเมจเอาต์พุต [ค่าเริ่มต้น: -หนึ่ง]

--output-ไดเรกทอรี , -o
เส้นทางระบบไฟล์สำหรับเขียนภาพโดยปิดสไลซ์เสีย (เช่น เติม a
ค่าการเติม) [ค่าเริ่มต้น: ไม่มี]

ผู้เขียน

Torsten Rohlfing โดยได้รับการสนับสนุนจาก Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff และ Yaroslav Halchenko

ใช้ cmtk-dwi_mask_bad_slices ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net