นี่คือคำสั่ง dbifastae ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
dbifasta - จัดทำดัชนีฐานข้อมูลไฟล์ fasta
เรื่องย่อ
ดบีฟาสตา -dbname เชือก -idformat รายการ -ไดเรกทอรี ไดเรกทอรี -ชื่อไฟล์ เชือก
-ปล่อย เชือก - วันที่ เชือก -ฟิลด์ รายการ -ไม่รวม เชือก -แม็กซ์อินเด็กซ์ จำนวนเต็ม
- ตัวเลือกการจัดเรียง เชือก -การจัดเรียงระบบ บูล -ทำความสะอาด บูล -outfile ออกจากไฟล์
-indexoutdir คนนอก
ดบีฟาสตา -ช่วยด้วย
DESCRIPTION
ดบีฟาสตา เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Utils:Database indexing"
OPTIONS
อินพุต ส่วน
-dbname เชือก
-idformat รายการ
ค่าเริ่มต้น: idacc
-ไดเรกทอรี ไดเรกทอรี
ค่าเริ่มต้น: .
-ชื่อไฟล์ เชือก
ค่าเริ่มต้น: *.dat
ต้อง ส่วน
-ปล่อย เชือก
ค่าเริ่มต้น: 0.0
- วันที่ เชือก
ค่าเริ่มต้น: 00/00/00
ระดับสูง ส่วน
-ฟิลด์ รายการ
ค่าเริ่มต้น: acc
-ไม่รวม เชือก
-แม็กซ์อินเด็กซ์ จำนวนเต็ม
- ตัวเลือกการจัดเรียง เชือก
ตัวเลือกการจัดเรียง โดยทั่วไปคือ '-T' เพื่อใช้ไดเรกทอรีปัจจุบันสำหรับไฟล์งานและ '-k 1,1' ถึง
บังคับให้ GNU sort ใช้ฟิลด์แรก Default value: -T -k 1,1
-การจัดเรียงระบบ บูล
ค่าเริ่มต้น: Y
-ทำความสะอาด บูล
ค่าเริ่มต้น: Y
เอาท์พุต ส่วน
-outfile ออกจากไฟล์
-indexoutdir คนนอก
ค่าเริ่มต้น: .
ใช้ dbifastae ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
