นี่คือคำสั่ง e-PCR ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
e-PCR — ค้นหาไซต์ที่ติดแท็กตามลำดับ (STS) ในลำดับดีเอ็นเอ
เรื่องย่อ
อี-พีซีอาร์ [-เอชวี] [ตัวเลือก posix] stsfile [ฟาสต้า ... ] [compat-ตัวเลือก]
DESCRIPTION
โปรแกรมแทนที่การระเบิดในตำแหน่งของไพรเมอร์คู่บนจีโนมที่อาจ
ให้ผลผลิต PCR
OPTIONS
posix-ตัวเลือกคือ:
-ม=## มาร์จิ้น (ค่าเริ่มต้น 50)
-w=## ขนาดคำ (ค่าเริ่มต้น 7)
-n=## อนุญาตให้ไม่ตรงกันสูงสุด (ค่าเริ่มต้น 0)
-ก.=## อินเดลสูงสุดที่อนุญาต (ค่าเริ่มต้น 0)
-ฉ=## ใช้ ## คำไม่ต่อเนื่องกัน ช้าถ้า ##>1
-o =## ตั้งค่าไฟล์เอาต์พุต
-t =## กำหนดรูปแบบเอาต์พุต:
1 - คลาสสิก ช่วง (pos1..pos2)
2 - คลาสสิค จุดกึ่งกลาง
3 - ตาราง
4 - ตารางที่มีการจัดตำแหน่งในความคิดเห็น (ช้า)
-d=- ตั้งค่าช่วงขนาดเริ่มต้น (ค่าเริ่มต้น 100-350)
-p=+- เปิด/ปิดขั้นตอนหลังการฮิต
-v=## ธงคำฟุ่มเฟือย
-ก=ก|ฉ ใช้การจัดตำแหน่งล่วงหน้า (เฉพาะเมื่อมีช่องว่าง>0) ช้า
a - เสมอหรือ f - เป็น Fallback
-x=+- ใช้ไพรเมอร์ตัวพิมพ์เล็ก 5'-end (ค่าเริ่มต้น -)
-u=+- ตัวพิมพ์ใหญ่ไพรเมอร์ทั้งหมด (ค่าเริ่มต้น -)
compat-options (ตัวเลือก posix ที่ซ้ำกัน) คือ
M=## มาร์จิ้น (ค่าเริ่มต้น 50)
W=## ขนาดคำ (ค่าเริ่มต้น 7)
N=## จำนวนที่ไม่ตรงกันที่อนุญาต (ค่าเริ่มต้น 0)
G=## อินเดลสูงสุดที่อนุญาต (ค่าเริ่มต้น 0)
F=## ใช้ ## คำไม่ต่อเนื่อง
O=## ตั้งค่าไฟล์เอาต์พุตเป็น ##
T=## ตั้งค่ารูปแบบเอาต์พุต (1..3)
D=- ตั้งค่าช่วงขนาดเริ่มต้น
P=+- เปิด/ปิด Hit ภายหลัง
V=## ธงคำฟุ่มเฟือย
A=ก|ฉ ใช้การจัดตำแหน่งล่วงหน้า (เฉพาะเมื่อมีช่องว่าง>0) ช้า
a - เสมอหรือ f - เป็น Fallback
X=+- ใช้ไพรเมอร์ตัวพิมพ์เล็ก 5'-end (ค่าเริ่มต้น -)
U=+- ตัวพิมพ์ใหญ่ไพรเมอร์ทั้งหมด (ค่าเริ่มต้น -)
- กลาง เช่นเดียวกับ T=2
สอบถามข้อมูลเพิ่มเติม โทร อี-พีซีอาร์ โดยไม่มีทางเลือกใดๆ
ใช้ e-PCR ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
