นี่คือคำสั่ง garniere ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
garnier - ทำนายโครงสร้างรองของโปรตีนโดยใช้วิธี GOR
เรื่องย่อ
Garnier -ลำดับ ภาคต่อ -idc จำนวนเต็ม -outfile รายงาน
Garnier -ช่วยด้วย
DESCRIPTION
Garnier เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Protein:2D Structure"
OPTIONS
อินพุต ส่วน
-ลำดับ ภาคต่อ
ค้นหาระดับสูง ส่วน
-idc จำนวนเต็ม
ในบทความของพวกเขา GOR กล่าวถึงว่าถ้าคุณรู้บางอย่างเกี่ยวกับโครงสร้างรอง
เนื้อหาของโปรตีนที่คุณกำลังวิเคราะห์ คุณสามารถทำได้ดีกว่าในการทำนาย 'idc' คือ
ดัชนีเป็นชุดของอาร์เรย์ dharr[] และ dsarr[] ซึ่งให้ 'ค่าคงที่การตัดสินใจ'
(dch, dcs) ซึ่งเป็นออฟเซ็ตที่ใช้กับตุ้มน้ำหนักสำหรับเกลียวและชีต
(ขยาย) เงื่อนไข ดังนั้น idc=0 บอกว่าอย่าใช้การชดเชยค่าคงที่การตัดสินใจและ idc=1 ถึง 6
บ่งชี้ว่าควรใช้ออฟเซ็ต dch,dcs ผสมกัน
เอาท์พุต ส่วน
-outfile รายงาน
ใช้ garniere ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
