นี่คือคำสั่ง gbrowse ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
GBrowse2 - เบราว์เซอร์จีโนมทั่วไป
เรื่องย่อ
libbrowse-perl [-ชม]
การติดตั้ง
หากติดตั้ง Apache2 ในระบบ ซอฟต์แวร์ได้กำหนดค่าให้ลิงก์ URL กับ
ไดเรกทอรี GBrowse จำเป็นต้องรีสตาร์ท Apache เพื่อนำมาพิจารณา
การกำหนดค่ามีอยู่ในไฟล์ /etc/gbrowse2/apache2.conf
หากใช้เว็บเซิร์ฟเวอร์อื่น ควรอ้างอิงเทมเพลต apache2 เพื่อจับคู่ URL ใน
ในลักษณะเดียวกัน
การพึ่งพาอาศัย
มีการอ้างอิง Perl เพิ่มเติมเพื่อให้คุณสมบัติเพิ่มเติม โปรดอ้างอิง
ไปยังโมดูลเสริมในไฟล์ INSTALL สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม
การกำหนดค่า
เรียกดู2 ไฟล์การกำหนดค่าจะอยู่ใน /etc/gbrowse ไฟล์กำหนดค่าหลักคือ
GBrowse.conf ประกอบด้วยองค์ประกอบการกำหนดค่าส่วนกลาง ไฟล์การกำหนดค่าเฉพาะ
อยู่ในไดเร็กทอรีเดียวกันต่อ data data สำหรับรายละเอียดเพิ่มเติม ควรอ้างอิงถึง
เอกสาร Growse
การติดตั้งมีให้พร้อมกับตัวอย่างจีโนมของยีสต์
DESCRIPTION
GBrowse นั้นเรียบง่าย แต่สูง
เบราว์เซอร์จีโนมบนเว็บที่กำหนดค่าได้ เป็นส่วนประกอบ
โครงการฐานข้อมูลระบบสิ่งมีชีวิตแบบจำลองทั่วไป (GMOD)
คุณสมบัติบางอย่าง:
* ตานกพร้อมกันและมุมมองรายละเอียดของจีโนม;
* เลื่อน, ซูม, กึ่งกลาง;
* แนบ URL โดยพลการกับคำอธิบายประกอบใด ๆ
* ผู้ดูแลระบบสามารถปรับแต่งลำดับและลักษณะของแทร็กได้และ
ผู้ใช้;
* ค้นหาตาม ID คำอธิบายประกอบ ชื่อ หรือความคิดเห็น;
* รองรับคำอธิบายประกอบของบุคคลที่สามโดยใช้รูปแบบ GFF
* การตั้งค่าคงอยู่ตลอดเซสชัน
* DNA และ GFF ทิ้ง;
* การเชื่อมต่อกับฐานข้อมูลต่าง ๆ รวมถึง BioSQL และ Chado;
* รองรับหลายภาษา;
* โหลดคุณสมบัติบุคคลที่สาม;
* สถาปัตยกรรมปลั๊กอินที่ปรับแต่งได้ (เช่น เรียกใช้ BLAST, ดัมพ์ & นำเข้าจำนวนมาก
รูปแบบ ค้นหาโอลิโกนิวคลีโอไทด์ ออกแบบไพรเมอร์ สร้างแผนที่ข้อจำกัด
แก้ไขคุณสมบัติ)
เว็บ การเดินทาง
GBrowse สามารถเข้าถึงได้ที่ URL http://localhost/gbrowse2
ใช้ gbrowse ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
