นี่คือคำสั่ง genome-music-plot-mutation-relationp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
genome music plot mutation-relation - สร้างพล็อตผลลัพธ์จากการกลายพันธุ์-สัมพันธ์
เครื่องมือ
VERSION
เอกสารนี้อธิบายการกลายพันธุ์สัมพันธ์ของพล็อตเพลงจีโนมเวอร์ชัน 0.04 (2016-01-01 at
23:10:18)
เรื่องย่อ
พล็อตเพลงจีโนม สัมพันธ์การกลายพันธุ์ --input-matrix=? --output-pdf=?
[--ข้าม-ศูนย์-mut-samples] [--genes-to-plot=?] [--plot-genes-in-order-listed]
ที่จำเป็น อาร์กิวเมนต์
อินพุต-เมทริกซ์ เชือก
ยีน/เมทริกซ์ตัวอย่างที่สร้างโดยเครื่องมือที่เกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์
เอาต์พุต-pdf เชือก
ไฟล์ pdf เอาต์พุตเพื่อวาดพล็อตไปที่
ตัวเลือก อาร์กิวเมนต์
ข้ามศูนย์-mut-ตัวอย่าง บูลีน
อย่าพล็อตตัวอย่างที่ไม่มีการกลายพันธุ์ของยีนที่กำลังวางแผน
ค่าเริ่มต้น 'จริง' หากไม่ได้ระบุ
noskip-zero-mut-ตัวอย่าง บูลีน
ทำให้ตัวอย่างข้ามศูนย์กลาย 'เท็จ'
ยีนต่อพล็อต เชือก
รายการยีนที่จะพล็อตโดยคั่นด้วยเครื่องหมายจุลภาค (ตัวอย่าง: DNMT3A,NPM1)
พล็อตยีนตามลำดับรายการ บูลีน
พล็อตยีนตามลำดับที่ระบุไว้ ค่าเริ่มต้นคือการพล็อตพวกเขาจากมากไปน้อย
เรียงตามจำนวนการกลายพันธุ์
ค่าเริ่มต้น 'เท็จ' (--noplot-genes-in-order-listed) หากไม่ได้ระบุไว้
noplot-gene-in-order-listed บูลีน
ทำให้การพล็อตยีนในลำดับรายการเป็น 'เท็จ'
DESCRIPTION
รับเมทริกซ์ที่สร้างขึ้นโดยใช้ "music mutation-relation --mutation-matrix-file" เครื่องมือนี้
จะสร้างโครงเรื่องที่เน้นความผูกขาดซึ่งกันและกันหรือความสอดคล้องกันระหว่าง
สถานะการกลายพันธุ์ของชุดยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้า
ใช้ genome-music-plot-mutation-relationp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
