นี่คือคำสั่ง gt-stat ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gt-stat - แสดงสถิติเกี่ยวกับคุณสมบัติที่มีอยู่ในไฟล์ GFF3
เรื่องย่อ
gt stat [ตัวเลือก ...] [GFF3_file ...]
DESCRIPTION
-การกระจายความยาวยีน [ใช่|ไม่]
แสดงการกระจายความยาวยีน (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-genescoredistri [ใช่|ไม่]
แสดงการแจกแจงคะแนนยีน (ค่าเริ่มต้น: ไม่ใช่)
-exonlengthdistri [ใช่|ไม่]
แสดงการกระจายความยาว exon (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-exonnumberdistri [ใช่|ไม่]
แสดงการกระจายหมายเลข exon (ค่าเริ่มต้น: ไม่ใช่)
-ความยาวอินตรอนdistri [ใช่|ไม่]
แสดงการกระจายความยาวอินตรอน (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-cdslengthdistri [ใช่|ไม่]
แสดงการกระจายความยาว CDS (วัดเป็นกรดอะมิโน) (ค่าเริ่มต้น: ไม่ใช่)
ที่มา- [ใช่|ไม่]
แสดงชุดของแท็กแหล่งที่มาที่ใช้ (คอลัมน์ 2 ในบรรทัด GFF3 ปกติ) (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-แอดดินตรอน [ใช่|ไม่]
เพิ่มคุณสมบัติ intron ระหว่างคุณสมบัติ exon ที่มีอยู่ (ก่อนคำนวณสถิติ) (ค่าเริ่มต้น:
ไม่)
-v [ใช่|ไม่]
ละเอียด (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-o [ชื่อไฟล์]
เปลี่ยนเส้นทางเอาต์พุตไปยังไฟล์ที่ระบุ (ค่าเริ่มต้น: ไม่ได้กำหนด)
-gzip [ใช่|ไม่]
เขียนไฟล์เอาต์พุตที่บีบอัด gzip (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-bzip2 [ใช่|ไม่]
เขียนไฟล์เอาต์พุตบีบอัด bzip2 (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-บังคับ [ใช่|ไม่]
บังคับให้เขียนไปยังไฟล์เอาต์พุต (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-ช่วยด้วย
แสดงความช่วยเหลือและออก
-version
แสดงข้อมูลเวอร์ชันและออก
รายงาน ข้อบกพร่อง
รายงานจุดบกพร่องไปที่[ป้องกันอีเมล]>.
ใช้ gt-stat ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
