เขมร - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

ขอม - การนับ k-mer การกรองและการข้ามผ่านกราฟ FTW!

เขมรเป็นห้องสมุดและชุดเครื่องมือสำหรับทำการวิเคราะห์และแปลงชุดข้อมูลตาม k-mer

เรื่องย่อ

ขอม [ตัวเลือก] args

เช่น.

ขอม โหลดเข้านับ -x 1e8 -k 20 reads.ct read.fa.gz

การใช้

manpage นี้อธิบายเท่านั้น ขอม สคริปต์เสื้อคลุม หากต้องการทราบข้อมูลเกี่ยวกับซอฟต์แวร์และ
วิธีใช้งาน โปรดดู /usr/share/doc/khmer หรือ else http://khmer.readthedocs.org/.

บน Debian/Ubuntu ผู้ดูแลแพ็คเกจจะหลีกเลี่ยงการวางสคริปต์จำนวนมากโดยตรง
เข้าไปในระบบ PATH แทนที่จะใช้สคริปต์ตัวตัดทอนตัวเดียวเพื่อเรียกใช้สคริปต์คุณ
ต้องการใช้; ดังนั้นหากคำสั่งเขมรบอกให้วิ่ง load-in-counting.py
...อะไรก็ตาม... คุณต้องนำหน้าคำสั่งนี้ด้วย ขอม. นอกจากนี้ นามสกุล .py
อาจถูกละเว้นส่งผลให้คำสั่งของรูปแบบที่แสดงด้านบน

หากคุณไม่ชอบสิ่งนี้ เพียงเพิ่ม /usr/lib/khmer/bin ใน PATH ส่วนตัวของคุณ

ใช้เขมรออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net