นี่คือคำสั่ง ltrsift ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
ltrsift - ส่วนต่อประสานกราฟิกสำหรับการประมวลผลภายหลังและการจัดประเภท LTR
ผู้สมัคร retrotransposon
เรื่องย่อ
ltrift
DESCRIPTION
LTRsift เป็นเครื่องมือเดสก์ท็อปแบบกราฟิกสำหรับการประมวลผลภายหลังกึ่งอัตโนมัติของการคาดการณ์ล่วงหน้า
คำอธิบายประกอบ LTR retrotransposon เช่นที่สร้างโดย LTRharvest และ LTRdigest
การกำหนดค่า
ไบนารี LAST (lastal และ lastdb) ควรอยู่ในเส้นทางการค้นหาของระบบ ถ้าพวกเขา
ไม่ได้ เป็นไปได้ไหมที่จะระบุตำแหน่งโดยใช้สภาพแวดล้อม “GT_LAST_PATH"
ตัวแปรก่อนที่จะรัน LTRsift เช่นเดียวกับตำแหน่ง BLAST ใช้
``GT_BLAST_PATH" เพื่อระบุพาธแบบเต็มไปยังไฟล์ปฏิบัติการ "blastall"
ไฟล์รูปแบบ (อธิบายลักษณะไดอะแกรมเชิงเส้นของคุณสมบัติผู้สมัคร) ได้
ตั้งค่าผ่านตัวแปรสภาพแวดล้อม LTRSIFT_STYLE_FILE มีการสร้างสไตล์เริ่มต้นที่สมเหตุสมผล
เป็น LTRsift
ใช้ ltrsift ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net