นี่คือคำสั่ง maskAlignedReads ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
maskAlignedReads.py - มาสก์จัดแนวอ่านในไฟล์ภูมิภาค
DESCRIPTION
การใช้งาน: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpไฟล์ inRgnFofn ออกRgnFofn
ใช้ in.cmp.h5 เพื่อปกปิดขอบเขตที่เกี่ยวข้องของไฟล์ใน in.rgn.h5 เขียนเอาต์พุตไปยังไฟล์ใหม่
rgn.fofn
ตำแหน่ง ข้อโต้แย้ง:
ในCmpFile
ไฟล์ cmp.h5 อินพุต
ในRgnFofn
ไฟล์ตารางภูมิภาคอินพุต
ออกRgnFofn
ไฟล์ตารางภูมิภาคเอาต์พุต
ไม่จำเป็น ข้อโต้แย้ง:
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
-v, --รุ่น
แสดงหมายเลขเวอร์ชันของโปรแกรมและออก
-l ล็อกไฟล์ --logFile ล็อกไฟล์
ระบุไฟล์ที่จะเข้าสู่ระบบ ค่าเริ่มต้นเป็น stderr (ค่าเริ่มต้น: ไม่มี)
-d, --debug
เพิ่มความละเอียดของการบันทึก (ค่าเริ่มต้น: เท็จ)
-i, --ข้อมูล
แสดงรายการบันทึกที่ให้ข้อมูล (ค่าเริ่มต้น: เท็จ)
ใช้ maskAlignedReads ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
