EnglishFrenchSpanish

เรียกใช้เซิร์ฟเวอร์ | Ubuntu > | Fedora > |


ไอคอน Fav ของ OnWorks

mincaverage - ออนไลน์ในคลาวด์

เรียกใช้ mincaverage ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks ผ่าน Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

นี่คือคำสั่ง mincaverage ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

โครงการ:

ชื่อ


mincaverage - ไฟล์ minc เฉลี่ย

เรื่องย่อ


mincaveage [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

DESCRIPTION


Mincaverage เฉลี่ยไฟล์ minc เข้าด้วยกัน อนุญาตให้มีพฤติกรรมทางเลือกที่หลากหลายเช่น
ดี: การปรับปริมาตรก่อนการทำให้เป็นมาตรฐาน, การสร้างปริมาตรส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน, ค่าเฉลี่ยมากกว่า a
ขนาดที่ระบุของไฟล์อินพุต

OPTIONS


โปรดทราบว่าตัวเลือกสามารถระบุในรูปแบบย่อได้ (ตราบใดที่ไม่ซ้ำกัน) และ
สามารถให้ที่ใดก็ได้บนบรรทัดคำสั่ง

General ตัวเลือก


-2 สร้างไฟล์เอาต์พุตรูปแบบ MINC 2.0

-ทุบ
เขียนทับไฟล์ที่มีอยู่

-Noclobber
อย่าเขียนทับไฟล์ที่มีอยู่ (ค่าเริ่มต้น)

-verbose
พิมพ์ข้อมูลความคืบหน้าสำหรับแต่ละกลุ่มข้อมูลที่คัดลอก (ค่าเริ่มต้น)

-เงียบ อย่าพิมพ์ข้อมูลความคืบหน้า

-debug พิมพ์ข้อมูลเพิ่มเติม (เช่น ปัจจัยการทำให้เป็นมาตรฐาน)

-filelist ชื่อไฟล์
ระบุไฟล์ที่มีรายชื่อไฟล์อินพุต หากได้รับ "-" แสดงว่าไฟล์
ชื่อจะอ่านจาก stdin หากได้รับตัวเลือกนี้ ก็ไม่ควรมีการป้อนข้อมูล
ชื่อไฟล์ที่ระบุในบรรทัดคำสั่ง บรรทัดว่างในไฟล์อินพุตคือ
ละเว้น

-max_buffer_size_in_kb ขนาดบัฟเฟอร์
ระบุขนาดสูงสุดของบัฟเฟอร์ภายใน (เป็น kbytes) ค่าเริ่มต้นคือ4096
กิโลไบต์

เอาท์พุต ชนิด ตัวเลือก


ตัวเลือกเหล่านี้ควบคุมความแม่นยำในการจัดเก็บข้อมูลและขนาดของค่า voxel แต่ละรายการใน
ไฟล์ที่ส่งออก

-filetype
อย่าทำการแปลงประเภทใด ๆ (ค่าเริ่มต้น)

-byte เขียนค่าจำนวนเต็ม 8 บิต

-สั้น เขียนค่าจำนวนเต็ม 16 บิต

-int เขียนค่าจำนวนเต็ม 32 บิต

-ยาว แทนที่โดย -int

-ลอย เขียนค่าจุดลอยตัวที่มีความแม่นยำเดียว

-Double
เขียนค่าทศนิยมที่มีความแม่นยำสองเท่า

-ลงนาม เขียนค่าเป็นจำนวนเต็มที่ลงนาม (ค่าเริ่มต้นสำหรับระยะสั้นและระยะยาว) ละเว้นสำหรับ
ประเภทจุดลอยตัว

-ไม่ได้ลงนาม
เขียนค่าเป็นจำนวนเต็มที่ไม่ได้ลงนาม (ค่าเริ่มต้นสำหรับไบต์) ละเว้นสำหรับลอย
ประเภทจุด

-พิสัย นาที แม็กซ์
ระบุช่วงที่ถูกต้องของค่าเอาต์พุต voxel ในการแทนค่าจำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้นคือช่วงเต็มสำหรับประเภทและเครื่องหมาย ตัวเลือกนี้ถูกละเว้นสำหรับ
ค่าจุดลอยตัว เพื่อให้มีผลคุณต้องระบุประเภท

เฉลี่ย ตัวเลือก


-ทำให้เป็นมาตรฐาน
ปรับปริมาณให้เป็นค่าเฉลี่ยทั่วโลกก่อนที่จะหาค่าเฉลี่ย (อิงตามค่าเฉลี่ย
ของว็อกเซลที่มีค่ามากกว่า 2 เปอร์เซ็นต์ของช่วงเต็มเหนือค่าต่ำสุด)

-nonormalize
อย่าปรับระดับเสียงให้เป็นปกติ (ค่าเริ่มต้น)

-sdfile sdfile.mnc
ระบุชื่อไฟล์ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานเอาท์พุตที่จะคำนวณเพิ่มเติม
ค่าเฉลี่ยที่คำนวณตามปกติ

-weightfile weightfile.mnc
ระบุเอาต์พุตไฟล์น้ำหนัก voxel สะสม (ค่าเริ่มต้น=ไม่มี)

-copy_header
คัดลอกข้อมูลส่วนหัวเพิ่มเติมทั้งหมดจากไฟล์อินพุตแรก (ค่าเริ่มต้น
สำหรับไฟล์อินพุตหนึ่งไฟล์)

-nocopy_header
อย่าคัดลอกข้อมูลส่วนหัวเพิ่มเติม (ค่าเริ่มต้นสำหรับไฟล์อินพุตจำนวนมาก)

-avgdim dimname
ระบุชื่อมิติที่เราควรหาค่าเฉลี่ย (หรือคำนวณ
ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน). หากทำให้เป็นมาตรฐาน ก็ยังใช้ได้เฉพาะกับที่แยกจากกัน
ไฟล์เท่านั้น - ไม่มีการทำให้เป็นมาตรฐานภายในไฟล์

-binarize
แปลงปริมาณอินพุตให้เป็นไบนารีก่อนคำนวณค่าเฉลี่ย การทำไบนารี่เสร็จแล้ว
โดยระบุช่วงของค่าที่ส่งผลต่อค่าเฉลี่ย 1 การทำให้เป็นมาตรฐานของ
อินพุตไม่ได้รับอนุญาตเมื่อดำเนินการไบนารี

-binrange นาที แม็กซ์
ระบุช่วงของค่าสำหรับไบนารี

-binvalue ความคุ้มค่า
ระบุค่าทางกฎหมายเดียว (จำนวนเต็ม) สำหรับไบนารี ช่วงถูกตั้งค่าเป็น +/-
0.5 รอบค่านี้เพื่อให้เกิดการปัดเศษของค่าอินพุตที่มีประสิทธิภาพ

-ignore_below ความคุ้มค่า
อย่ารวม voxels ที่ต่ำกว่าค่านี้ในค่าเฉลี่ยและ sd

-ignore_above ความคุ้มค่า
อย่ารวม voxel ที่สูงกว่าค่านี้ในค่าเฉลี่ยและ sd

- ชั้น ความคุ้มค่า
คำพ้องความหมายสำหรับ -ignore_below

-ignore_above ความคุ้มค่า
คำพ้องความหมายสำหรับ -ignore_above

- น้ำหนัก
ระบุชุดของน้ำหนักสำหรับการหาค่าเฉลี่ย จำนวนค่าน้ำหนักต้อง
ตรงกับจำนวนไฟล์อินพุตและต้องระบุค่าเป็นไฟล์เดียว
อาร์กิวเมนต์ด้วยเครื่องหมายจุลภาคหรือช่องว่างเป็นตัวคั่น ผลรวมของน้ำหนักจะต้องไม่
ศูนย์. หากใช้ตุ้มน้ำหนักกับมิติการเฉลี่ย ไฟล์อินพุตเดียวเท่านั้นที่สามารถ
ระบุไว้

-width_weighted
ตัวเลือกนี้ใช้ได้เฉพาะเมื่อหาค่าเฉลี่ยข้ามมิติ (-avgdim ตัวเลือก). มัน
ระบุว่าการถ่วงน้ำหนักควรทำโดยใช้ตัวแปรความกว้างที่สอดคล้อง
สู่มิติเฉลี่ย ตัวอย่างเช่น ใช้ -width_weighted กับ -avgdim เวลา
จะใช้ตัวแปร time-width เพื่อถ่วงน้ำหนักค่า

-min_weight ความคุ้มค่า
ระบุน้ำหนักขั้นต่ำ (จำนวนเล่มถ้าไม่ได้ระบุน้ำหนัก)
ที่จำเป็นสำหรับการคำนวณค่าเฉลี่ยที่ถูกต้อง ถ้าน้ำหนักสะสมของว็อกเซลคือ
ต่ำกว่าเกณฑ์นี้ ค่าเฉลี่ยและ sd ที่รายงานจะเป็น 0 ซึ่งโดยทั่วไปจะเป็น
จะมีประโยชน์หากไม่รวมค่าโดยใช้ตัวใดตัวหนึ่ง -ไม่สนใจ ตัวเลือกหรือตามค่า NaN
ในปริมาณอินพุต

-min_weight_fraction ความคุ้มค่า
เหมือนกับ -min_weightแต่ระบุเป็นเศษส่วนของผลรวมของน้ำหนักอินพุต
(หรือจำนวนอินพุต หากไม่ระบุน้ำหนัก)

ทั่วไป ตัวเลือก for ทั้งหมด คำสั่ง:


-ช่วยด้วย พิมพ์สรุปตัวเลือกบรรทัดคำสั่งและออก

-version
พิมพ์หมายเลขเวอร์ชันของโปรแกรมและออก

ใช้ mincaverage ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net


Ad


Ad