นี่คือคำสั่ง seqstat ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
seqstat - แสดงสถิติและรูปแบบสำหรับไฟล์ลำดับ
เรื่องย่อ
สถิติ [ตัวเลือก] ไฟล์ seq
DESCRIPTION
สถิติ อ่านไฟล์ลำดับ ไฟล์ seq และแสดงสถิติง่ายๆ เกี่ยวกับเรื่องนี้
สถิติที่พิมพ์รวมถึงชื่อของรูปแบบ, ประเภทการตกค้างของครั้งแรก
ลำดับ (โปรตีน RNA หรือ DNA) จำนวนลำดับ จำนวนเรซิดิวทั้งหมด
และค่าเฉลี่ยและพิสัยของความยาวลำดับ
OPTIONS
-a แสดงข้อมูลโดยละเอียดเพิ่มเติม: ตารางที่มีหนึ่งบรรทัดต่อลำดับที่แสดง
ชื่อ ความยาว และบรรทัดรายละเอียด บรรทัดเหล่านี้นำหน้าด้วยอักขระ * to
เปิดใช้งานได้อย่างง่ายดาย เกรป'คัดแยกและคัดแยกออก
-h พิมพ์ความช่วยเหลือสั้น ๆ รวมหมายเลขเวอร์ชันและบทสรุปของตัวเลือกทั้งหมด รวมทั้ง
ตัวเลือกผู้เชี่ยวชาญ
-B (บาเบลฟิช). ตรวจหาอัตโนมัติและอ่านรูปแบบไฟล์ลำดับอื่นที่ไม่ใช่ค่าเริ่มต้น
(ฟาสต้า). รู้จักรูปแบบไฟล์ลำดับทั่วไปเกือบทุกรูปแบบ (รวมถึง Genbank,
รูปแบบลำดับที่ไม่สอดคล้องกัน EMBL, SWISS-PROT, PIR และ GCG และสตอกโฮล์ม, GCG MSF
และรูปแบบการจัดตำแหน่งคลัสเตอร์) ดูเอกสารที่พิมพ์สำหรับรายการทั้งหมด
ของรูปแบบที่รองรับ
EXPERT OPTIONS
--ข้อมูล
ระบุว่าไฟล์ลำดับอยู่ในรูปแบบ , แทนที่จะเป็นค่าเริ่มต้น FASTA
รูปแบบ. ตัวอย่างทั่วไป ได้แก่ Genbank, EMBL, GCG, PIR, Stockholm, Clustal, MSF,
หรือฟิลลิป; ดูเอกสารที่พิมพ์สำหรับรายการรูปแบบที่ยอมรับทั้งหมด
ชื่อ. ตัวเลือกนี้จะแทนที่รูปแบบที่คาดไว้เริ่มต้น (FASTA) และ -B
ตัวเลือกการตรวจจับอัตโนมัติของ Babelfish
--เงียบ
ระงับส่วนหัวแบบละเอียด (ชื่อโปรแกรม หมายเลขรุ่นและวันที่ พารามิเตอร์
และตัวเลือกที่มีผลใช้บังคับ)
ใช้ seqstat ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
