ภาษาอังกฤษภาษาฝรั่งเศสสเปน

Ad


ไอคอน Fav ของ OnWorks

WigeoN - ออนไลน์ในคลาวด์

เรียกใช้ WigeoN ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks ผ่าน Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

นี่คือคำสั่ง WigeoN ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

โครงการ:

ชื่อ


wigeon - การนำยูทิลิตี้การตรวจจับความผิดปกติของ Pintail 16S DNA กลับมาใช้ใหม่

DESCRIPTION


WigeoN ตรวจสอบการอนุรักษ์ลำดับระหว่างแบบสอบถามและการอ้างอิงที่เชื่อถือได้
ลำดับ ทั้งในรูปแบบการจัดตำแหน่ง NAST ขึ้นอยู่กับเอกลักษณ์ของลำดับระหว่างแบบสอบถาม
และลำดับอ้างอิง มีจำนวนการแปรผันที่คาดหวังระหว่างการจัดตำแหน่ง
หากความแปรผันที่สังเกตพบมีค่ามากกว่าควอนไทล์ 95% ของการกระจายตัวของ
การแปรผันที่สังเกตพบระหว่างลำดับที่ไม่ผิดปกติ จากนั้นจะถูกตั้งค่าสถานะเป็นความผิดปกติ

WigeoN คือการนำเอาอัลกอริทึม Pintail Appl . มาใช้บรรทัดคำสั่งใหม่อีกครั้ง
สิ่งแวดล้อมไมโครไบโอล 2005 ธ.ค.;7112:7724-36.

WigeoN มีประโยชน์สำหรับการตั้งค่าสถานะ chimeras และความผิดปกติใน 16S rRNA . ที่มีความยาวเกือบเต็มเท่านั้น
ลำดับ WigeoN ขาดความไวโดยมีลำดับน้อยกว่า 1000 bp

ในการรัน WigeoN คุณต้องมีลำดับการจัดรูปแบบ NAST ที่สร้างโดยยูทิลิตี้ nast-ier

WigeoN เป็นส่วนหนึ่งของชุดไมโครไบโอมิวทิล

OPTIONS


จำเป็นต้องใช้:
--query_NAST
ไฟล์ multi-fasta ที่มีลำดับคิวรีในรูปแบบการจัดตำแหน่ง

ตัวเลือก:
--db_NAST
db ในรูปแบบ NAST

--db_FASTA
db ในรูปแบบ fasta (จัดรูปแบบ megablast)

--num_top_hits
ค่าเริ่มต้น 1: ใช้การจับคู่ที่ดีที่สุดเพียงรายการเดียวเท่านั้น

--พล็อต

--ดีบั๊ก

--exec_dir
cd ถึง exec_dir ก่อนรัน

ใช้ WigeoN ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net


เซิร์ฟเวอร์และเวิร์กสเตชันฟรี

ดาวน์โหลดแอพ Windows & Linux

  • 1
    เครื่องมือคำนวณ
    เครื่องมือคำนวณ
    ซอร์ส Java มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้เป็น
    Nexus สำหรับการสอนทั้งคณิตศาสตร์และ
    ซอฟต์แวร์โซลูชั่นสำหรับการคำนวณบน
    สมการวนซ้ำ อินเทอร์เฟซสาธารณะ
    อนุญาตให้ก...
    ดาวน์โหลดเครื่องมือคำนวณ
  • 2
    Rocket.Chat ไคลเอนต์เดสก์ท็อป
    Rocket.Chat ไคลเอนต์เดสก์ท็อป
    ไคลเอนต์เดสก์ท็อป Rocket.Chat คือ
    แอปเดสก์ท็อปอย่างเป็นทางการสำหรับ Rocket.Chat
    เว็บโอเพ่นซอร์สที่เรียบง่ายแต่ทรงพลัง
    แพลตฟอร์มแชท มีการทดสอบบน macOS
    หน้าต่าง...
    ดาวน์โหลด Rocket.Chat Desktop Client
  • 3
    ชั้นสำนักงาน
    ชั้นสำนักงาน
    OfficeFloor ให้การผกผันของ
    การควบคุม coupling ด้วย: - การพึ่งพา
    ฉีด - ฉีดต่อเนื่อง -
    ฉีดด้าย สอบถามเพิ่มเติม
    เยี่ยมชม...
    ดาวน์โหลด OfficeFloor
  • 4
    DivKit
    DivKit
    DivKit เป็นโอเพ่นซอร์สที่ขับเคลื่อนด้วยเซิร์ฟเวอร์
    กรอบงาน UI (SDUI) มันช่วยให้คุณ
    เปิดตัวการอัปเดตที่มาจากเซิร์ฟเวอร์ไปยัง
    แอพเวอร์ชันต่างๆ นอกจากนี้ยังสามารถเป็นได้
    ใช้สำหรับ...
    ดาวน์โหลด DivKit
  • 5
    ตัวแปลงย่อย
    ตัวแปลงย่อย
    ยูทิลิตี้เพื่อแปลงระหว่างต่างๆ
    รูปแบบการสมัครสมาชิก ผู้ใช้ Shadowrocket
    ควรใช้ ss, ssr หรือ v2ray เป็นเป้าหมาย
    คุณสามารถเพิ่ม &remark= ใน
    HT ที่ชอบโทรเลข...
    ดาวน์โหลดตัวแปลงย่อย
  • 6
    สวอช
    สวอช
    SWASH เป็นตัวเลขเอนกประสงค์
    เครื่องมือจำลองความไม่มั่นคง
    ไม่อุทกสถิต, ฟรีพื้นผิว,
    ปรากฏการณ์การไหลหมุนและการขนส่ง
    ในน่านน้ำชายฝั่งเช่น ...
    ดาวน์โหลด SWASH
  • เพิ่มเติม»

คำสั่ง Linux

Ad