นี่คือคำสั่ง xtractore ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
xtractore - แยกลำดับที่สอดคล้องกับคุณลักษณะที่มีคำอธิบายประกอบจากลำดับที่กำหนด
ไฟล์
เรื่องย่อ
เอ็กซ์แทรกเตอร์ [ตัวเลือก] features.gff3 Sequences.fasta
DESCRIPTION
ตัวเลือก:
-d|--ดีบัก
เอาต์พุตการดีบักการพิมพ์
-h|--ช่วยเหลือ
พิมพ์ข้อความช่วยเหลือนี้แล้วออก
-i|--idfile: ไฟล์
ไฟล์ที่มีรายการรหัสคุณลักษณะ (1 ต่อบรรทัดโดยไม่มีช่องว่าง); ถ้าให้
เฉพาะคุณสมบัติที่มี ID ในไฟล์นี้เท่านั้นที่จะถูกแยกออก
-o|--outfile: ไฟล์
ไฟล์ที่จะเขียนลำดับเอาต์พุต ค่าเริ่มต้นคือเทอร์มินัล (stdout)
-t|--ประเภท: STRING
ประเภทคุณลักษณะที่จะแยก; สามารถใช้หลายครั้งเพื่อแยกคุณสมบัติของหลาย ๆ
ชนิด
-v|--รุ่น
พิมพ์หมายเลขรุ่นและออก
-V|--ละเอียด
พิมพ์คำเตือนและข้อความแสดงข้อผิดพลาดอย่างละเอียด
-w|--ความกว้าง: INT
ความกว้างของแต่ละบรรทัดของลำดับในเอาต์พุต Fasta ค่าเริ่มต้นคือ 80; ตั้งค่าเป็น 0 สำหรับ no
การจัดรูปแบบ
ใช้ xtractore ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
