นี่คือแอป Linux ชื่อ EXCAVATOR-tool เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า EXCAVATOR-tool เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
EXCAVATOR-เครื่องมือที่ทำงานบน Linux ออนไลน์
DESCRIPTION
ความสนใจ!!!!! ความสนใจ !!!!! ความสนใจ !!!!! ความสนใจ !!!!!เราเพิ่งเผยแพร่บน BMC Genomics ซึ่งเป็นแพ็คเกจซอฟต์แวร์ใหม่ชื่อ XCAVATOR สำหรับการระบุ CNV/CNA จากการทดลองหาลำดับจีโนมทั้งแบบระยะสั้นและระยะยาว (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR สามารถใช้ได้ฟรีที่ http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR เป็นชุดซอฟต์แวร์ใหม่สำหรับการตรวจหาตัวแปรหมายเลขสำเนา (CNV) จากข้อมูลการจัดลำดับทั้ง exome
EXCAVATOR ได้รับการตีพิมพ์ใน Genome Biology (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
#########################
ความสนใจ!!!!! ในการใช้เครื่องมือ EXCAVATOR อย่างถูกต้อง ผู้ใช้ต้องดาวน์โหลดไฟล์การแมป uniqueome ที่ลิงค์ต่อไปนี้:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (สำหรับ hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
คุณสมบัติ
- ลำดับรุ่นต่อไป
- คัดลอกหมายเลข Variants
- การจัดลำดับ Exome ทั้งหมด
ภาษาโปรแกรม
Perl
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/excavatortool/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
