นี่คือแอป Linux ชื่อ FusionCatcher ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น fusioncatcher_v1.33.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ FusionCatcher พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
FusionCatcher
Ad
DESCRIPTION
FusionCatcher ค้นหายีนฟิวชั่นโซมาติก การย้ายตำแหน่ง และคิเมราที่แปลกใหม่/เป็นที่รู้จักในข้อมูล RNA-seq (การอ่านแบบคู่ขนานจากแพลตฟอร์ม Illumina NGS เช่น Solexa และ HiSeq) จากตัวอย่างที่เป็นโรค
จุดมุ่งหมายของ FusionCatcher คือ:
- อัตราการตรวจจับที่ดีมากสำหรับการค้นหายีนฟิวชันของผู้สมัคร
- ใช้งานง่ายมาก (เช่น ไม่จำเป็นต้องมีความรู้เบื้องต้นเกี่ยวกับฐานข้อมูลและชีวสารสนเทศเพื่อเรียกใช้ FusionCatcher)
- การตรวจจับยีนฟิวชันที่ท้าทายได้ดีมาก เช่น ฟิวชัน IGH, ฟิวชัน CIC, ฟิวชัน DUX4, ฟิวชัน CRLF2, ฟิวชัน TCF3 เป็นต้น
- ให้เป็นไปโดยอัตโนมัติมากที่สุด (เช่น FusionCatcher จะเลือกพารามิเตอร์ที่ดีที่สุดโดยอัตโนมัติเพื่อค้นหายีนฟิวชั่นของผู้สมัคร เช่น การค้นหาอะแดปเตอร์โดยอัตโนมัติ การสร้างจุดเชื่อมต่อ exon-exon โดยอัตโนมัติตามความยาวของอินพุตที่อ่าน ฯลฯ) ในขณะที่ให้อัตราการตรวจจับที่ดีที่สุดสำหรับการค้นหายีนฟิวชัน
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
