นี่คือแอป Linux ชื่อ Hadoop-BAM ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น hadoop-bam-7.1.0.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Hadoop-BAM พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ฮาดูป-แบม
Ad
DESCRIPTION
Hadoop-BAM คือไลบรารี Java สำหรับการจัดการไฟล์ในรูปแบบชีวสารสนเทศทั่วไปโดยใช้เฟรมเวิร์ก Hadoop MapReduce กับ Picard SAM JDK และเครื่องมือบรรทัดคำสั่งที่คล้ายกับ SAMtools
รูปแบบไฟล์ที่รองรับในปัจจุบัน ได้แก่ BAM, SAM, FASTQ, FASTA, QSEQ, BCF และ VCF
สำหรับคำอธิบายระดับสูงที่ยาวขึ้นของ Hadoop-BAM โปรดอ่านบทความ "Hadoop-BAM: การจัดการข้อมูลการเรียงลำดับรุ่นถัดไปในคลาวด์โดยตรง" ใน Bioinformatics เล่มที่ 28 ฉบับที่ 6 หน้า 876-877 มีให้ทางออนไลน์ที่: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts054
โปรดทราบว่าส่วนไลบรารีของ Hadoop-BAM มีไว้สำหรับนักพัฒนาที่มีประสบการณ์ในการใช้ Hadoop เป็นหลัก เครื่องมือบรรทัดคำสั่งของ Hadoop-BAM ควรเข้าใจได้สำหรับผู้ใช้ทุกคน แต่มีขอบเขตจำกัด
ดูโปรเจ็กต์ SeqPig สำหรับอินเทอร์เฟซระดับสูงกว่ากับรูปแบบไฟล์ที่ Hadoop-BAM รองรับ: http://seqpig.sourceforge.net
ดู Seal สำหรับเครื่องมือจัดตำแหน่งการอ่านแบบ Hadoop, Seal: http://biodoop-seal.sourceforge.net
ผู้ชม
นักพัฒนา
ภาษาโปรแกรม
ชวา
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
