PBSuite ที่จะทำงานใน Linux ดาวน์โหลดออนไลน์สำหรับ Linux

นี่คือแอป Linux ชื่อ PBSuite เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดเป็น PBSuite_15.8.24.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

PBSuite เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

ปัจจุบันนี้โฮสต์สองโครงการที่สร้างและดูแลโดย Adam English

PBJelly - เครื่องมืออัปเกรดจีโนม
PBHoney - เครื่องมือค้นพบรูปแบบโครงสร้าง

ทั้งสองมีอยู่ในรหัส PBSuite ที่พบในการดาวน์โหลด

----- พีเจลลี่ -----
อ่านกระดาษ
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768

PBJelly เป็นไปป์ไลน์แบบอัตโนมัติที่จัดลำดับการอ่านแบบยาว (เช่น การอ่าน PacBio RS หรือการอ่าน 454 แบบยาวในรูปแบบ fasta) ไปจนถึงการประกอบแบบร่างที่มีความมั่นใจสูง PBJelly เติมหรือลดช่องว่างที่จับได้มากที่สุดเท่าที่เป็นไปได้เพื่อสร้างจีโนมแบบร่างที่ได้รับการอัพเกรด

----- พีบีฮันนี่ -----
อ่านกระดาษ
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract

PBHoney เป็นการนำเอาวิธีการระบุตัวแปรสองวิธีมาใช้ ซึ่งออกแบบมาเพื่อใช้ประโยชน์จากความสามารถในการแมปที่สูงของการอ่านแบบยาว (เช่น มากกว่า 10,000 bp) PBHoney พิจารณาความไม่ลงรอยกันของการอ่านภายในและส่วนท้ายแบบอ่อนของการอ่านแบบยาวเพื่อระบุรูปแบบโครงสร้าง

คุณสมบัติ

• การประกอบจีโนม
• การอัพเกรดจีโนม
• การเปลี่ยนแปลงโครงสร้าง
• การประเมินการประกอบ

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ภาษาโปรแกรม

หลาม

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา