piv_clustering เพื่อทำงานใน Linux ดาวน์โหลดออนไลน์สำหรับ Linux

นี่คือแอป Linux ชื่อ piv_clustering เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น piv_clustering_1.3.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

piv_clustering เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

โปรแกรมนี้อนุญาตให้ทำการวิเคราะห์คลัสเตอร์โครงสร้างของวิถีอะตอมที่ได้รับ เช่น จากการจำลองไดนามิกของโมเลกุล

ที่ความแปรปรวนกับวิธีอื่นๆ เป็นไปได้ที่จะวิเคราะห์กระบวนการในสารละลายด้วย เช่น ปฏิกิริยาเคมีในน้ำของเหลว เนื่องจากการวัดระยะทางอิงตาม Permutation Invariant Vector (PIV) ที่สมมาตรภายใต้การแลกเปลี่ยนอะตอมหรือโมเลกุลที่เหมือนกัน ซึ่งรวมถึง บนพื้นฐานเดียวกันทั้งองศาอิสระของตัวถูกละลายและตัวทำละลาย วิธีการนี้เป็นแนวทางทั่วไป และคำจำกัดความของ PIV จำเป็นต้องระบุช่วงของระยะทางระหว่างอะตอมที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการที่กำลังศึกษาอยู่เท่านั้น อีกทางหนึ่ง สามารถใช้พิกัดทอพอโลยี SPRINT ได้ ซึ่งเหมาะอย่างยิ่งสำหรับโครงสร้างนาโน

ผลลัพธ์คือการแบ่งส่วนของวิถีออกเป็นกลุ่มโครงสร้างบางส่วน (เช่น ชุดของเฟรม) ซึ่งช่วยให้วิเคราะห์และแสดงภาพได้ง่ายขึ้น

โปรดอ่านและอ้างอิง Gallet & Pietrucci, J. Chem สรีรวิทยา 139, 074101 (2013)

คุณสมบัติ

• การจัดกลุ่มโครงสร้างของวิถีอะตอม
• ค่าคงที่การเปลี่ยนแปลง: ผลึก ของแข็งอสัณฐาน ของเหลว โครงสร้างนาโน
• รองรับเซลล์จำลองทั้งหมด (ตั้งแต่ออร์โธโรบิกไปจนถึงไทรคลินนิน)
• การใช้ MPI แบบขนาน

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ภาษาโปรแกรม

ฟอร์แทรน

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/pivclustering/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา