EnglishFrenchSpanish

เรียกใช้เซิร์ฟเวอร์ | Ubuntu > | Fedora > |


ไอคอน Fav ของ OnWorks

ดาวน์โหลด Protospacer Workbench สำหรับ Linux

ดาวน์โหลดแอป Protospacer Workbench Linux ฟรีเพื่อทำงานออนไลน์ใน Ubuntu ออนไลน์, Fedora ออนไลน์หรือ Debian ออนไลน์

นี่คือแอป Linux ชื่อ Protospacer Workbench ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Protospacer Workbench พร้อม OnWorks ฟรี

ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:

- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ

- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว

- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้

- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้

ภาพหน้าจอ

Ad


โต๊ะทำงาน Protospacer


DESCRIPTION

Protospacer Workbench ช่วยในการออกแบบ วิเคราะห์ และแบ่งปันไซต์เป้าหมาย CRISPR สำหรับสิ่งมีชีวิตใดๆ หรือชุดของลำดับการจัดรูปแบบ FASTA

การออกแบบ Guide-RNA สำหรับระบบแก้ไขจีโนม CRISPR/Cas นั้นง่ายโดยสัญชาตญาณ แต่ยากในการคำนวณ ความยากหลักเกิดจากความจำเป็นในการระบุเป้าหมายนอกเป้าหมายที่อาจค่อนข้างแตกต่างจากเป้าหมายที่ตั้งใจไว้ เครื่องมือออนไลน์ในปัจจุบันสำหรับการออกแบบ guide-RNA ให้ส่วนต่อประสานกับผู้ใช้ที่เป็นมิตรต่อซอฟต์แวร์การทำแผนที่ตามลำดับ เช่น Bowtie หรือ BLAST อย่างไรก็ตาม แม้ว่าอัลกอริธึมการทำแผนที่เหล่านี้จะทำได้อย่างรวดเร็ว แต่ก็ไม่ได้ออกแบบมาให้มีความทนทานต่อข้อผิดพลาดสูง ซึ่งเป็นคุณลักษณะที่สำคัญอย่างยิ่งต่อการกำหนดเป้าหมายนอกเป้าหมายที่อาจเกิดขึ้น เมื่อเครื่องมือออนไลน์ล้มเหลว เครื่องมือออฟไลน์ก็ประสบความสำเร็จ อย่างไรก็ตาม เครื่องมือออฟไลน์ต้องการความรู้เกี่ยวกับบรรทัดคำสั่งซึ่งมีเพียงไม่กี่คนที่ใช้ CRISPR Protospacer Workbench มุ่งหวังที่จะเชื่อมช่องว่างระหว่างการออกแบบ RNA คู่มือออนไลน์และออฟไลน์ ซอฟต์แวร์นี้พร้อมใช้งานสำหรับ OS X และจะถูกย้ายไปยังระบบปฏิบัติการอื่นในเร็วๆ นี้

คุณสมบัติ

  • ค้นหาเป้าหมาย CRISPR ที่มีอยู่ทั้งหมดอย่างรวดเร็ว
  • ประเมินการออกแบบ guide-RNA อย่างละเอียด
  • แบ่งปันเป้าหมายและรายการแนะนำ-RNA
  • ออกแบบสำหรับสิ่งมีชีวิตใดๆ
  • จัดการหลายฐานข้อมูล
  • ขั้นตอนการทำงานทีละขั้นตอน
  • รับรายงานเกี่ยวกับประสิทธิภาพของ Guide-RNA ที่คาดหวัง
  • ใช้เครื่องมือของบุคคลที่สามหลายตัวจากอินเทอร์เฟซเดียว
  • การออกแบบหลายเป้าหมาย
  • จัดการรายการเป้าหมาย/คู่มือ-RNA ขนาดใหญ่


นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา


Ad


Ad