นี่คือแอป Linux ชื่อ sgRNAcas9 ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น sgRNAcas9_3.0.5.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ sgRNAcas9 พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
sgRNAcas9
DESCRIPTION
แพ็คเกจนี้ประกอบด้วยโปรแกรมเพื่อทำการค้นหาไซต์เป้าหมาย CRISPR (โปรโตสเปเซอร์) ด้วยพารามิเตอร์ที่กำหนดโดยผู้ใช้ ทำนายไซต์ความแตกแยกที่เป็นไปได้นอกเป้าหมายที่เป็นไปได้ของ Cas9 ทั่วทั้งจีโนม จำแนก POT ออกเป็นสามประเภท โอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบแบทช์สำหรับการสร้าง 20 -nt (นิวคลีโอไทด์) หรือเวคเตอร์การแสดงออก sgRNA ที่ถูกตัดปลาย ดึงลำดับนิวคลีโอไทด์ที่มีความยาวที่ต้องการซึ่งขนาบข้างตำแหน่งการตัดแยกบนหรือนอกเป้าหมายสำหรับการออกแบบคู่ไพรเมอร์ PCR เพื่อตรวจสอบการกลายพันธุ์โดยการสอบวิเคราะห์ความแตกแยก T7E1 ที่สำคัญ โดยการระบุไซต์นอกเป้าหมายที่เป็นไปได้ใน silico sgRNAcas9 ช่วยให้สามารถเลือกไซต์เป้าหมายที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้นและช่วยในการระบุไซต์นอกเป้าหมายโดยแท้จริง อำนวยความสะดวกอย่างมากในการออกแบบ sgRNA สำหรับแอปพลิเคชันการแก้ไขจีโนมอ้างอิง: Xie S, ShenB,Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: แพ็คเกจซอฟต์แวร์สำหรับการออกแบบ CRISPR sgRNA และการประเมินไซต์ที่มีความแตกแยกนอกเป้าหมายที่อาจเกิดขึ้น ป.ล. หนึ่ง 2014,9(6):e100448.
http://www.biootools.com/
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา