นี่คือแอป Linux ชื่อ SnowyOwl ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ SnowyOwl-2.0.3.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ SnowyOwl พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
นกเค้าแมวหิมะ
DESCRIPTION
SnowyOwl เป็นไปป์ไลน์การทำนายยีนที่ใช้ข้อมูล RNA-Seq เพื่อฝึกและให้คำแนะนำสำหรับการสร้างการคาดการณ์ยีนตาม Hidden Markov Model (HMM) และเพื่อประเมินแบบจำลองผลลัพธ์ ไปป์ไลน์ได้รับการตรวจสอบและเพิ่มประสิทธิภาพโดยการเปรียบเทียบการคาดการณ์กับแบบจำลองยีนที่ดูแลจัดการด้วยตนเองในจีโนมของเชื้อรา 26 ตัว และผลลัพธ์ที่ได้แสดงให้เห็นถึงความไวและความสามารถในการคัดเลือกที่เพิ่มขึ้นอย่างมากเมื่อเทียบกับการทำนายยีนครั้งก่อน ความไวได้มาจากการเรียกใช้ตัวทำนายยีน HMM ออกัสตัสซ้ำๆ ด้วยพารามิเตอร์อินพุตที่หลากหลาย และการเลือกโดยการเลือกแบบจำลองที่มีความคล้ายคลึงกันที่ดีที่สุดกับโปรตีนที่รู้จักและข้อตกลงที่ดีที่สุดกับข้อมูล RNA-Seq SnowyOwl ประสบความสำเร็จในการทำนายยีนในจีโนมของเชื้อรา XNUMX ชนิด
สามารถติดตั้งไปป์ไลน์ในเครื่องเพื่อปริมาณงานสูงและควบคุมการกำหนดค่าได้ นอกจากนี้ยังสามารถเรียกใช้บนเซิร์ฟเวอร์ระยะไกลผ่านเว็บอินเทอร์เฟซที่สะดวกสำหรับการใช้งานเป็นครั้งคราว
คุณสมบัติ
- การทำนายยีนโดยใช้ข้อมูล RNA-Seq
- ความไวและความจำเพาะสูง
- ไปป์ไลน์ได้รับการปรับปรุงและตรวจสอบด้วยแบบจำลองยีนที่ดูแลจัดการด้วยตนเอง
- กำหนดค่าได้สูง
- การกำหนดค่าเริ่มต้นสำหรับ ascomycete และ basidiomycete fungi
- ติดตั้งและเรียกใช้ในเครื่องเพื่อการควบคุมและความยืดหยุ่น
- เรียกใช้จากระยะไกลผ่านเว็บอินเตอร์เฟสเพื่อความสะดวก
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย ผู้ใช้ขั้นสูง
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บนเว็บ, Command-line, GTK+
ภาษาโปรแกรม
ไพธอน, PHP
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/snowyowl/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา