นี่คือแอป Linux ชื่อ SuRankCo เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น surankco_r5.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ SuRankCo เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
SuRankCo ที่จะทำงานใน Linux ออนไลน์
Ad
DESCRIPTION
SuRankCo เป็นซอฟต์แวร์ที่ใช้แมชชีนเลิร์นนิงเพื่อทำคะแนนและจัดอันดับ contigs จากแอสเซมบลีของ novo ของข้อมูลการจัดลำดับรุ่นต่อไป มันฝึกการเรียงตัวของ contigs ที่มีจีโนมอ้างอิงที่รู้จัก และทำนายคะแนนและการจัดอันดับสำหรับ contig ที่ยังไม่มีจีโนมอ้างอิงที่เกี่ยวข้องเลยสำหรับรายละเอียดเพิ่มเติมเกี่ยวกับ SuRankCo และการทำงานของ SuRankCo โปรดดูที่
"SuRankCo: การกำกับดูแลการจัดอันดับของ Contigs ใน de novo Assemblies"
Mathias Kuhring, Piotr Wojtek Dabrowski, Andreas Nitsche และ Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
โปรดทราบ ขอแนะนำให้อ่านเอกสารและไฟล์ readme.txt ก่อนใช้ SuRankCo
อัปเดตมิถุนายน 2015:
* การเปลี่ยนแปลงเล็กน้อยเพื่อเปิดใช้งานการสนับสนุน BAM
อัปเดต ก.พ. 2014:
* เพิ่มการรองรับชุดประกอบ FASTA/SAM เพิ่มเติมจาก ACE/FASTQ(QUAL)
หมายเหตุ: คุณสมบัติของชุดประกอบ FASTA/SAM ยังไม่รวม BaseCount, BaseSeqmentCount และ ContigQualities
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
ชวา เอส/อาร์
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/surankco/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
