นี่คือแอป Windows ชื่อ Protospacer Workbench ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Protospacer Workbench พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ
Ad
โต๊ะทำงาน Protospacer
DESCRIPTION
Protospacer Workbench ช่วยในการออกแบบ วิเคราะห์ และแบ่งปันไซต์เป้าหมาย CRISPR สำหรับสิ่งมีชีวิตใดๆ หรือชุดของลำดับการจัดรูปแบบ FASTAการออกแบบ Guide-RNA สำหรับระบบแก้ไขจีโนม CRISPR/Cas นั้นง่ายโดยสัญชาตญาณ แต่ยากในการคำนวณ ความยากหลักเกิดจากความจำเป็นในการระบุเป้าหมายนอกเป้าหมายที่อาจค่อนข้างแตกต่างจากเป้าหมายที่ตั้งใจไว้ เครื่องมือออนไลน์ในปัจจุบันสำหรับการออกแบบ guide-RNA ให้ส่วนต่อประสานกับผู้ใช้ที่เป็นมิตรต่อซอฟต์แวร์การทำแผนที่ตามลำดับ เช่น Bowtie หรือ BLAST อย่างไรก็ตาม แม้ว่าอัลกอริธึมการทำแผนที่เหล่านี้จะทำได้อย่างรวดเร็ว แต่ก็ไม่ได้ออกแบบมาให้มีความทนทานต่อข้อผิดพลาดสูง ซึ่งเป็นคุณลักษณะที่สำคัญอย่างยิ่งต่อการกำหนดเป้าหมายนอกเป้าหมายที่อาจเกิดขึ้น เมื่อเครื่องมือออนไลน์ล้มเหลว เครื่องมือออฟไลน์ก็ประสบความสำเร็จ อย่างไรก็ตาม เครื่องมือออฟไลน์ต้องการความรู้เกี่ยวกับบรรทัดคำสั่งซึ่งมีเพียงไม่กี่คนที่ใช้ CRISPR Protospacer Workbench มุ่งหวังที่จะเชื่อมช่องว่างระหว่างการออกแบบ RNA คู่มือออนไลน์และออฟไลน์ ซอฟต์แวร์นี้พร้อมใช้งานสำหรับ OS X และจะถูกย้ายไปยังระบบปฏิบัติการอื่นในเร็วๆ นี้
คุณสมบัติ
- ค้นหาเป้าหมาย CRISPR ที่มีอยู่ทั้งหมดอย่างรวดเร็ว
- ประเมินการออกแบบ guide-RNA อย่างละเอียด
- แบ่งปันเป้าหมายและรายการแนะนำ-RNA
- ออกแบบสำหรับสิ่งมีชีวิตใดๆ
- จัดการหลายฐานข้อมูล
- ขั้นตอนการทำงานทีละขั้นตอน
- รับรายงานเกี่ยวกับประสิทธิภาพของ Guide-RNA ที่คาดหวัง
- ใช้เครื่องมือของบุคคลที่สามหลายตัวจากอินเทอร์เฟซเดียว
- การออกแบบหลายเป้าหมาย
- จัดการรายการเป้าหมาย/คู่มือ-RNA ขนาดใหญ่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
