Ito ang command na bp_run_protdist.plp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
run_neighbor - patakbuhin ang programang 'protdist' ni Phylip sa pamamagitan ng Bioperl
SINOPSIS
run_prottist [-i inputfile] [-o outfilename]
DESCRIPTION
Magbigay ng alignment file kung saan patakbuhin ang protdist. Dapat ay may pangalang .aln o .phy ang file.
Ito ay kinakailangan upang matukoy natin kung kailangan nating i-convert ang isang clustalw alignment sa
philip. Inaanyayahan kang palawigin ang script upang gumana sa iba pang mga format ng MSA na bioperl
sumusuporta. Ito ay inilaan upang magamit sa napakasimpleng manu-manong mga pipeline.
Ang input file ay dapat na pinangalanan sa anyo ng file.phy o file.aln inaasahan ng program a
file sa anyo ng (\S+)\.(\S+).
Tatakbo ito sa application na 'protdist' gamit ang formula na 'KIMURA' upang bumuo ng aa protein
distance matrix. Ang mga may philip3.6 ay gustong gumawa ng ilang mga pagbabago kung gusto nilang gamitin
JTT. Ikinagagalak kong tumulong na idagdag ito bilang argumento ng cmd-line kung ito ay hiniling.
Gamitin ang bp_run_protdist.plp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
