Ito ang command na bp_sreformatp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
bpsreformat - i-convert ang mga format ng pagkakasunud-sunod
DESCRIPTION
Ginagamit ng script na ito ang SeqIO system na nagbibigay-daan sa conversion ng mga format ng sequence
sequence data o maramihang sequence alignment data. Ang pangalan ay nagmula sa katotohanan na si Sean
Ginagawa na ito ng program sreformat ni Eddy (bahagi ng HMMER pkg). Sinusubukan ng programa ni Sean
upang hulaan ang mga format ng pag-input habang sa aming code ay kasalukuyang hinihiling namin sa iyo na tukuyin kung ano ang
input at output format ay at kung ang data ay mula sa isang maramihang pagkakahanay ng pagkakasunod-sunod o mula sa
tuwid na pagkakasunud-sunod na mga file.
Paggamit ng:
bpsreformat -kung INFORMAT -ng OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h/--help I-print ang tulong na ito
-if/--informat Tukuyin ang input format
-of/--outformat Tukuyin ang output format
-i/--input Tukuyin ang pangalan ng input file
(upang magpasa ng data sa STDIN gumamit ng minus sign bilang filename)
-o/--output Tukuyin ang pangalan ng output file
(upang magpasa ng data sa STDOUT gumamit ng minus sign bilang filename)
--msa Tukuyin ito ay maramihang sequence alignment data
--special Magpapasa sa mga espesyal na parameter sa AlignIO/SeqIO
object -- karamihan sa mga ito ay para sa Bio::AlignIO objects
Pinaghiwalay ng kuwit ang listahan ng mga sumusunod
nointerleaved -- para sa phylip, non-interleaved na format
idlinebreak -- para sa phylip, ginagawa itong molphy format
mga porsyento -- para sa clustalw, ipakita ang % id bawat linya
Gamitin ang bp_sreformatp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
