cmtk-dwi_mask_bad_slices - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

dwi_mask_bad_slices - Maghanap ng mga masamang hiwa sa hanay ng mga larawang may timbang sa pagsasabog.

SINOPSIS

dwi_mask_bad_slices DiffusionImagePaths

DESCRIPTION

Ang tool na ito ay nagbabasa ng isang hanay ng mga 3D diffusion-weighted na larawan ng MR at nakakahanap ng masasamang hiwa. Isang masamang hiwa
sa isang diffusion na imahe ay nakita bilang isa na ang ibig sabihin ng intensity ay nasa labas ng isang tinukoy
pagitan sa paligid ng ibig sabihin ng mga paraan ng lahat ng kaukulang hiwa mula sa natitira
mga larawan ng pagsasabog.

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

input Options
--b0count
Bilang ng b=0 na larawan sa simula ng listahan ng larawan. Ang mga ito ay hindi kasama sa
ang masamang pag-detect ng slice o masking, ngunit isinulat din sa direktoryo ng output para sa
kaginhawaan. Ipinapalagay na ang lahat ng b=0 na imahe ay nasa simula ng listahan ng
input ng mga imahe, ngunit hindi sa dulo o sa gitna. [Default: 0]

--slice-orientation
Tukuyin ang oryentasyon ng slice ng mga diffusion na imahe. Mga sinusuportahang halaga: "axial",
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", kung saan ang default ay "axial",
o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--ehe
Mga hiwa ng axial [Ito is ang default]

--sagittal
Mga hiwa ng Sagittal

--coronal
Mga hiwa ng korona

--hiwa-x
Ang X coordinate axis ay direksyon ng slice

--hiwa-y
Ang Y coordinate axis ay direksyon ng slice

--hiwa-z
Ang Z coordinate axis ay direksyon ng slice [Ito is ang default]

Masama Hiwa Paniniktik
--stdev
Threshold para sa masamang pagkakakilanlan ng slice sa mga unit ng intensity standard deviations tapos na
lahat ng kaukulang mga hiwa mula sa natitirang mga larawan ng pagsasabog. [Default: 3]

Pagbubuhos Options
--convert-to
Uri ng data ng scaler para sa mga larawang output. Kung ang iyong padding value ay negatibo ngunit ang iyong
input ng data na hindi nalagdaan, halimbawa, siguraduhing pumili ng nilagdaang uri ng data para sa
output. Bilang default, ang uri ng data ng output ay kapareho ng uri ng input. Sinusuportahan
mga halaga: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double", o paggamit
isa sa mga sumusunod:

--char
8 bits, nilagdaan

--byte
8 bits, hindi nalagdaan

--maikli
16 bits, nilagdaan

--ushort
16 bits, hindi nalagdaan

--int
32 bits na nilagdaan

--uint
32 bits unsigned

--lumutang
32 bits na lumulutang na punto

--doble
64 bits na lumulutang na punto

--padding-value , -p
Padding value para palitan ang data ng mga nakitang masasamang hiwa sa mga output na larawan. [Default: -1]

--output-directory , -o
Ang path ng file system para sa pagsusulat ng mga larawang may masamang hiwa na nakamaskara (ibig sabihin, puno ng a
halaga ng padding). [Default: WALA]

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gumamit ng cmtk-dwi_mask_bad_slices online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net