dcmstack - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

dcmstack - DICOM sa NIfTI converter

DESCRIPTION

paggamit: dcmstack [-h] [--force-read] [--file-ext FILE_EXT] [--allow-dummies]

[--dest-dir DEST_DIR] [-o OUTPUT_NAME] [--output-ext OUTPUT_EXT] [-d]
[--embed-meta] [-g GROUP_BY] [--voxel-order VOXEL_ORDER] [-t TIME_VAR]
[--vector-var VECTOR_VAR] [--time-order TIME_ORDER] [--vector-order VECTOR_ORDER]
[-l] [--disable-translator DISABLE_TRANSLATOR] [--extract-private] [-i
INCLUDE_REGEX] [-e EXCLUDE_REGEX] [--default-regexes] [-v] [--strict] [--version]
[src_dirs [src_dirs ...]]

I-stack ang mga file ng DICOM mula sa bawat source na direktoryo sa 2D hanggang 5D na mga volume, opsyonal na i-extract
meta data.

posibilidad mga argumento:
src_dirs
Ang pinagmulang mga direktoryo na naglalaman ng mga DICOM file.

opsyonal mga argumento:
-h, - Tumulong
ipakita ang mensahe ng tulong na ito at lumabas

input na pagpipilian:
--force-read
Subukang basahin ang lahat ng mga file bilang DICOM, kahit na nawawala ang preamble.

--file-ext FILE_EXT
Subukan lamang na magbasa ng mga file na may ibinigay na extension. Default: .dcm

--payagan-dummies
Payagan ang mga DICOM file na walang pixel data, na pinupunan ang hiwa ng output
nifti na may pinakamataas na halaga na kinakatawan.

Pagbubuhos na pagpipilian:
--dest-dir DEST_DIR
Direktoryo ng patutunguhan, nagde-default sa direktoryo ng pinagmulan.

-o OUTPUT_NAME, --output-pangalan OUTPUT_NAME
Python format string na tumutukoy sa mga output filename batay sa DICOM tags.

--output-ext OUTPUT_EXT
Ang extension para sa uri ng output file. Default: .nii.gz

-d, --dump-meta
Itapon ang na-extract na meta data sa isang JSON file na may parehong pangalan ng base tulad ng
nabuo ang Nifti

--embed-meta
I-embed ang na-extract na meta data sa isang Nifti header extension (sa JSON format).

Stacking Pagpipilian:
-g GROUP_BY, --group-by GROUP_BY
Comma seperated na listahan ng mga meta data key para ipangkat ang mga input file sa mga stack.

--voxel-order VOXEL_ORDER
Pag-order ng mga voxel upang magsimula ang mga spatial na indeks mula sa mga direksyong ito sa pasyente
space. Ang mga direksyon sa espasyo ng pasyente ay dapat ibigay bilang tatlong character code:
(l)kaliwa, (r)kanan, (a)panloob, (p)osterior, (s)uperior, (i)inferior. Pagpasa ng isang walang laman
hindi papaganahin ng string ang reorientation. Default: LAS

-t TIME_VAR, --time-var TIME_VAR
Ang keyword ng elemento ng DICOM na gagamitin para sa pag-order ng stack kasama ang dimensyon ng oras.

--vector-var VECTOR_VAR
Ang keyword ng elemento ng DICOM na gagamitin para sa pag-order ng stack kasama ang dimensyon ng vector.

--oras ng order ORAS NG ORDER
Magbigay ng text file na may nais na pagkakasunud-sunod para sa mga halaga (isa sa bawat linya) ng
attribute na ginamit bilang variable ng oras. Ang pagpipiliang ito ay bihirang kailanganin.

--vector-order VECTOR_ORDER
Magbigay ng text file na may nais na pagkakasunud-sunod para sa mga halaga (isa sa bawat linya) ng
attribute na ginamit bilang vector variable. Ang pagpipiliang ito ay bihirang kailanganin.

meta Bunutan at Pagsasala Pagpipilian:
-l, --list-translators
Ilista ang mga pinaganang tagasalin at lumabas

--disable-translator DISABLE_TRANSLATOR
Huwag paganahin ang mga tagasalin para sa mga ibinigay na tag. Dapat ibigay ang mga tag sa format
"0x0_0x0". Higit sa isa ang maaaring ibigay sa isang listahang pinaghihiwalay ng kuwit. Kung ang salitang "lahat"
ay ibinigay, ang lahat ng mga tagapagsalin ay hindi paganahin.

--extract-pribado
I-extract ang meta data mula sa mga pribadong elemento, kahit na walang tagasalin. Kung ang
ang halaga para sa elemento ay naglalaman ng mga non-ascii byte na ito ay hindi pa rin papansinin. Ang
ang na-extract na meta data ay maaari pa ring ma-filter ng mga regular na expression.

-i INCLUDE_REGEX, --include-regex INCLUDE_REGEX
Isama ang anumang meta data kung saan tumutugma ang key sa ibinigay na regular na expression. Ito
ay i-o-override ang anumang pagbubukod ng mga expression. Nalalapat sa lahat ng meta data.

-e EXCLUDE_REGEX, --exclude-regex EXCLUDE_REGEX
Ibukod ang anumang meta data kung saan tumutugma ang key sa ibinigay na regular na expression. Ito
ay pupunan ang default na pagbubukod ng mga expression. Nalalapat sa lahat ng meta data.

--default-regexes
I-print ang listahan ng default na isama at ibukod ang mga regular na expression at exit.

Pangkalahatan Pagpipilian:
-v, --verbose
Mag-print ng karagdagang impormasyon.

--mahigpit
Nabigo sa unang pagbubukod sa halip na magpakita ng babala.

--bersyon
Ipakita ang bersyon at lumabas.

RESPONSIBILIDAD MO NA MALAMAN KUNG MAY PRIBADONG IMPORMASYON SA KALUSUGAN SA METADATA
HINUHOT NG PROGRAMANG ITO.

Gumamit ng dcmstack online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net