Ito ang command demux na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
demux - I-convert ang XPLOR distance restraints sa Gromacs format
SINOPSIS
demux md0.log dagdag
DESCRIPTION
Kung gusto mong gawing tuloy-tuloy muli ang iyong mga trajectory maaari mong gamitin demux upang basahin
ang iyong md0.log file (maaari mong pagsamahin ang ilan kung kinakailangan) at gumawa ng ilang output
mga file. Isa sa mga ito ay isang .xvg file (replica_ndx.xvg) na maaaring ipasa sa trjcat(1) kasama
gamit ang orihinal na mga file ng tilapon, upang makagawa ng tuluy-tuloy na mga tilapon. Yung isa
file (replica_temp.xvg) ay naglalaman ng mga temperatura para sa bawat replika, simula sa
orihinal na temperatura. Kaya kung ang replica ng interes mo ay magsisimula sa, sabihin nating, 300 K, maaari mong sundin
ang trajectory nito sa pamamagitan ng temperatura na espasyo. Ito ay magiging kawili-wiling magdagdag ng ilan
functionality na gumawa ng histograms ng mga distribusyon ng temperatura para sa bawat replica, na
ayon sa karamihan ng mga may-akda, dapat ay flat. Ang demuxed trajectories ay maaaring gamitin sa
g_kinetics(1) upang makakuha ng protein folding kinetics mula sa REMD trajectories.
Opsyon
md0.log Log file ng trajectory run na gusto mong gawin ng tuloy-tuloy. Maramihang mga file ay maaaring
pinagsama-sama.
dagdag Bilang ng beses na kokopyahin ang bawat entry sa log file. (Integer)
LIMITASYON
Kung ang palitan mo ay bawat N ps at nai-save mo ang bawat M ps na magagawa mo para sa nawawala
mga frame sa pamamagitan ng pagtatakda dagdag sa (N/M - 1). Kung hindi integer ang N/M, wala kang swerte at ikaw
ay hindi magagawang i-demux ang iyong mga trajectory sa lahat.
Gumamit ng demux online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
