Ito ang command na e-PCR na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
e-PCR — Maghanap ng sequence tagged sites (STS) sa mga sequence ng DNA
SINOPSIS
e-PCR [-hV] [posix-options] stsfile [fasta ...] [compat-options]
DESCRIPTION
Pinapalitan ng programa ang sabog sa lokasyon ng mga pares na primer sa genome na maaaring
magbunga ng produkto ng PCR.
Opsyon
ang mga opsyon sa posix ay:
-m=## Margin (default 50)
-w=## Laki ng salita (default 7)
-n=## Pinahihintulutan ang mga max na hindi pagkakatugma (default 0)
-g=## Pinapayagan ang max indels (default 0)
-f=## Gumamit ng ## hindi magkatugmang mga salita, mabagal kung ##>1
-o=## Itakda ang output file
-t=## Itakda ang format ng output:
1 - classic, range (pos1..pos2)
2 - classic, midpoint
3 - talahanayan
4 - tabular na may pagkakahanay sa mga komento (mabagal)
-d=##-## Itakda ang default na hanay ng laki (default 100-350)
-p=+- I-on/i-off ang mga hit postprocess
-v=## Mga flag ng verbosity
-a=a|f Gumamit ng mga alignment ng presize (kung may gaps>0 lang), mabagal
a - Palaging o f - bilang Fallback
-x=+- Gumamit ng 5'-end lowercase masking ng mga primer (default -)
-u=+- Malaking titik ang lahat ng panimulang aklat (default -)
compat-options (duplicate posix-options) ay
M=## Margin (default 50)
W=## Laki ng salita (default 7)
N=## Bilang ng mga hindi pagkakatugma na pinapayagan (default 0)
G=## Pinapayagan ang max indels (default 0)
F=## Gumamit ng ## mga salitang walang tigil
O=## Itakda ang output file sa ##
T=## Itakda ang format ng output (1..3)
D=##-## Itakda ang default na hanay ng laki
P=+- Naka-on/off ang postprocess hit
V=## Mga flag ng verbosity
A=a|f Gumamit ng mga alignment ng presize (kung may gaps>0 lang), mabagal
a - Palaging o f - bilang Fallback
X=+- Gumamit ng 5'-end lowercase masking ng mga primer (default -)
U=+- Malaking titik ang lahat ng panimulang aklat (default -)
-kalagitnaan Kapareho ng T=2
Para sa impormasyon tungkol sa karagdagang mga opsyon tumawag lamang e-PCR nang walang anumang mga pagpipilian.
Gumamit ng e-PCR online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
