Ito ang command na ecogrep na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
ecogrep - pag-filter ng resulta ng ecoPCR batay sa taxonomic id filter at regular na expression
huwaran
SINOPSIS
ecogrep [mga pagpipilian] filename
DESCRIPTION
Ang ecoPCR ay isang electronic PCR software na binuo ng LECA at Helix-Project. Nakakatulong ito sa
tantyahin ang kalidad ng mga panimulang aklat sa Barcode.
Ang program na ito ay kabilang sa exoPCR package.
Opsyon
-1 : [UNA] : ihambing ang ibinigay na pattern sa direktang strand oligonucleotide
-2 : [PANGALAWA] : ihambing ang ibinigay na pattern sa reverse strand oligonucleotide
-d : [D]atabase na naglalaman ng taxonomic na impormasyon
-e : [E]rrors : pinapayagan ang maximum na error sa pattern match (opsyon-1, -2 at -p) (0 ni
default)
-p : [P]attern : pattern ng oligonucleotide
-h : [H]help : print tulong
-i : [I]balewala ang subtree sa ilalim ng ibinigay na taxonomic id
-r : [R]paghigpitan ang paghahanap sa subtree sa ilalim ng ibinigay na taxomic id
-v : in[V]ert ang kahulugan ng pagtutugma, upang pumili ng hindi magkatugmang mga linya.
argumento:
pangalan ng file ng output ng ecoPCR
Gamitin ang ecogrep online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
