Ito ang command na edialigne na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
edialign - Lokal na maramihang pag-align ng mga sequence
SINOPSIS
edialign -mga pagkakasunod-sunod seqset -nucmode listahan -revcomp boolean [-overlapw pagpili]
[-kaugnayan listahan] [-maxfragl kabuuan] -fragmat boolean -fragsim kabuuan
[-itscore boolean] [- threshold lumutang] -maskara boolean -dostars boolean
-starnum kabuuan -outfile outfile -outseq seqoutall
edialign -tulong
DESCRIPTION
edialign ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Ito ay bahagi ng "Alignment:Multiple" command group(s).
Opsyon
input seksyon
-mga pagkakasunod-sunod seqset
karagdagan seksyon
-nucmode listahan
Nucleic acid sequence alignment mode (simple, isinalin o halo-halong) Default na halaga: n
-revcomp boolean
Default na halaga: N
-overlapw pagpili
Bilang default, ang mga overlap na timbang ay ginagamit kapag Nseq =<35 ngunit maaari mo itong itakda sa 'oo' o
'no' Default na halaga: default (kapag Nseq =< 35)
-kaugnayan listahan
Clustering method para bumuo ng sequence tree (UPGMA, minimum linkage o maximum
linkage) Default na halaga: UPGMA
-maxfragl kabuuan
Default na halaga: 40
-fragmat boolean
Default na halaga: N
-fragsim kabuuan
Default na halaga: 4
-itscore boolean
Default na halaga: N
- threshold lumutang
Default na halaga: 0.0
Pagbubuhos seksyon
-maskara boolean
Default na halaga: N
-dostars boolean
Default na halaga: N
-starnum kabuuan
Default na halaga: 4
-outfile outfile
-outseq seqoutall
Gumamit ng ediaaligne online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
