Ito ang command na fastaq-to_perfect_reads na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
fastaq_to_perfect_reads - Gumawa ng perpektong ipinares na mga pagbabasa mula sa sanggunian
DESCRIPTION
paggamit: fastaq_to_perfect_reads [mga opsyon]
paglihis>
Gumagawa ng perpektong ipinares na dulo ng fastq reads mula sa isang sequence file, na may mga insert na laki na na-sample mula sa
isang normal na distribusyon. Read orientation ay innies. Ang output ay isang interleaved na FASTQ file.
posibilidad mga argumento:
infile Pangalan ng input file
outfile
Pangalan ng output file
ibig sabihin laki ng insert
Mean insert size ng read pairs
ipasok ang std deviation
Standard devvation ng laki ng insert
ibig sabihin coverage
Mean coverage ng mga binasa
haba ng pagbasa
Haba ng bawat binasa
opsyonal mga argumento:
-h, - Tumulong
ipakita ang mensahe ng tulong na ito at lumabas
--mga fragment FILENAME
Sumulat ng FASTA na mga pagkakasunud-sunod ng mga fragment (ibig sabihin, basahin ang mga pares kasama ang mga pagkakasunud-sunod sa pagitan ng mga ito)
sa ibinigay na filename
--hindi_n Huwag payagan ang anumang N o n character sa mga nabasa
--binhi Int
Binhi para sa random number generator. Ang default ay ang paggamit ng default ng python
Gumamit ng fastaq-to_perfect_reads online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
