Ito ang command na fastaq-to_tiling_bam na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
fastaq_to_tiling_bam - Gumawa ng BAM file ng mga nabasa na pantay na nakakalat sa input
sanggunian
DESCRIPTION
paggamit: fastaq_to_tiling_bam [mga opsyon]
Kumuha ng sequence file. Gumagawa ng BAM file na naglalaman ng perpektong (walang paired) na nagbabasa ng pag-tile ng
buong genome
posibilidad mga argumento:
infile Pangalan ng input fasta/q file
haba_basa
Ang haba ng binasa
read_step
Distansya sa pagitan ng simula ng bawat pagbasa
read_prefix
Prefix ng mga binasang pangalan
outfile
Pangalan ng output BAM file
opsyonal mga argumento:
-h, - Tumulong
ipakita ang mensahe ng tulong na ito at lumabas
--qual_char QUAL_CHAR
Karakter na gagamitin para sa marka ng kalidad [I]
--read_group READ_GROUP
Idagdag ang ibinigay na read group ID sa lahat ng reads [42]
Mahalaga: ipinapalagay na ang samtools ay nasa iyong landas
Gamitin ang fastaq-to_tiling_bam online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
