Ito ang command na fdnamlke na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
fdnamlk - Tinatantya ang nucleotide phylogeny ayon sa pinakamataas na posibilidad
SINOPSIS
fdnamlk -pagkakasunod-sunod seqsetall -intreefile puno [-mga kategorya kabuuan] -bahala ayos
-mga kategorya mga katangian [-mga timbang mga katangian] [-ttratio lumutang] [-freqsfrom toggle]
-basefreq ayos [-gamma listahan] -gammacoefficient lumutang -ngammacat kabuuan
-invarcoefficient lumutang -ninvarcat kabuuan -invarfrac lumutang
-nhmmcategories kabuuan -hmmrates ayos -hmmprobabilities ayos -adjsite boolean
-lambda lumutang -jumble kabuuan -binhi kabuuan -pandaigdig boolean - mga haba boolean
-outfile outfile [-trout toggle] -outtreefile outfile [-printdata boolean]
[- pag-unlad boolean] [-treeprint boolean] [-hypstate boolean]
fdnamlk -tulong
DESCRIPTION
fdnamlk ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Ito ay bahagi ng (mga) command group na "Phylogeny:Molecular sequence".
Opsyon
input seksyon
-pagkakasunod-sunod seqsetall
File na naglalaman ng isa o higit pang pagkakahanay ng sequence
-intreefile puno
-mga kategorya kabuuan
Default na halaga: 1
-bahala ayos
-mga kategorya mga katangian
-mga timbang mga katangian
karagdagan seksyon
-ttratio lumutang
Default na halaga: 2.0
-freqsfrom toggle
Default na halaga: Y
-basefreq ayos
Default na halaga: 0.25 0.25 0.25 0.25
-gamma listahan
Default na halaga: Constant rate
-gammacoefficient lumutang
Default na halaga: 1
-ngammacat kabuuan
Default na halaga: 1
-invarcoefficient lumutang
Default na halaga: 1
-ninvarcat kabuuan
Default na halaga: 1
-invarfrac lumutang
Default na halaga: 0.0
-nhmmcategories kabuuan
Default na halaga: 1
-hmmrates ayos
Default na halaga: 1.0
-hmmprobabilities ayos
Default na halaga: 1.0
-adjsite boolean
Default na halaga: N
-lambda lumutang
Default na halaga: 1.0
-jumble kabuuan
-binhi kabuuan
Default na halaga: 1
-pandaigdig boolean
Default na halaga: N
- mga haba boolean
Default na halaga: N
Pagbubuhos seksyon
-outfile outfile
-trout toggle
Default na halaga: Y
-outtreefile outfile
-printdata boolean
Default na halaga: N
- pag-unlad boolean
Default na halaga: Y
-treeprint boolean
Default na halaga: Y
-hypstate boolean
Default na halaga: N
Gumamit ng fdnamlke online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
