h5topng - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

h5topng - bumuo ng mga PNG na imahe mula sa 2d slice ng HDF5 file

SINOPSIS

h5topng [OPTION]... [HDF5FILE] ...

DESCRIPTION

Ang h5topng ay isang utility upang makabuo ng mga larawan sa PNG (Portable Network Graphics) na format mula sa
dalawang-dimensional na hiwa ng mga dataset sa HDF5 file. Ito ay dinisenyo para sa mabilis-at-marumi
visualization ng siyentipikong data, at para sa batch processing nito sa pamamagitan ng mga shell script.

Ang HDF5 ay isang libre, portable na binary na format at sumusuporta sa library na binuo ng National
Center for Supercomputing Applications sa University of Illinois sa Urbana-Champaign.
Isang solong h5 ang file ay maaaring maglaman ng maramihang mga set ng data; bilang default, h5topng kumukuha ng una
dataset, ngunit maaari itong baguhin sa pamamagitan ng -d opsyon, o sa pamamagitan ng paggamit ng syntax
HDF5FILE:DATASET.

Para sa isang three- o four-dimensional na dataset dapat mong tukuyin ang mga coordinate sa isa o dalawang slice
mga sukat, ayon sa pagkakabanggit, upang makakuha ng dalawang-dimensional na hiwa, sa pamamagitan ng -xyzt mga pagpipilian. Higit pa
kinokontrol ng mga opsyon ang mga bagay tulad ng colormap at magnification. Gayunpaman, ang pinakapangunahing paggamit
ay isang bagay tulad ng ´h5topng foo.h5´, na maglalabas ng file na foo.png na naglalaman ng larawan
mula sa dalawang-dimensional na data sa foo.h5.

Opsyon

-h Ipakita ang tulong sa mga opsyon sa command-line at paggamit.

-V I-print ang numero ng bersyon at impormasyon ng copyright para sa h5topng.

-v Verbose na output. Kasama sa output na ito ang minimum at maximum na mga value na nakatagpo sa
ang data, na kapaki-pakinabang na malaman para sa -mM mga pagpipilian.

-o file
Ipadala ang PNG na output sa file sa halip na sa filename na may .h5 na pinalitan ng .png
(ang default).

-x ix, -y iy, -z iz, -t it
Sinasabi nito h5topng upang gumamit ng isang partikular na slice ng isang multi-dimensional na dataset. hal
-x nagiging sanhi ng paggamit ng yz plane (ng isang 3d dataset), sa x index ng ix (kung saan ang
ang mga indeks ay tumatakbo mula sa zero hanggang isang mas mababa kaysa sa pinakamataas na index sa direksyong iyon). dito,
Ang x/y/z ay tumutugma sa una/pangalawa/ikatlong dimensyon ng HDF5 dataset. Ang -t
ang opsyon ay tumutukoy sa isang slice sa huling dimensyon, alinman iyon. Tingnan din
ang -0 opsyong ilipat ang pinanggalingan ng x/y/z slice coordinates sa dataset
gitna.

Sa halip na tukuyin ang isang index bilang argumento sa mga opsyong ito, maaari mo rin
tukuyin ang isang hanay ng mga indeks sa isang Matlab-like notation: simula:hakbang:dulo or simula:dulo
(hakbang default sa 1). Ito ay umiikot sa slice index na iyon, mula sa simula sa dulo sa mga hakbang
of hakbang, na gumagawa ng pagkakasunod-sunod ng mga output PNG file (na may slice index na nakadugtong sa
ang filename, bago ang ".png").

-0 Ilipat ang pinanggalingan ng mga coordinate ng x/y/z slice sa dataset center, upang hal
-0 -x 0 (o mas compactly -0x0) ay nagbabalik sa gitnang x plane ng dataset
ng gilid x eroplano. (-t hindi apektado ang mga coordinate.)

-X scalex, -Y kaliskis, -S sukatan
I-scale ang x at y na sukat ng imahe sa pamamagitan ng scalex at kaliskis ayon sa pagkakabanggit. Ang
-S sinusukat ng opsyon ang parehong x at y. Ang default ay ang paggamit ng scale factor na 1.0; ibig sabihin
ang imahe ay may parehong mga sukat (sa mga pixel) bilang ang data. Ang linear interpolation ay
ginagamit upang punan ang mga pixel kapag ang mga kadahilanan ng sukat ay hindi 1.0.

-s skewangle
I-skew ang larawan sa pamamagitan ng skewangle (sa mga degree) sa kaliwa o kanan. Ang resulta ay a
paralelogram, na may natirang espasyo sa (parisukat) na imahe na puno ng alinman
itim o puting mga pixel, depende sa mapa ng kulay.

-T I-transpose ang data (palitan ang mga axes ng imahe). Bilang default, ang unang (x)
ang coordinate ng data ay tumutugma sa mga column, at ang pangalawang (y) coordinate
tumutugma sa mga hilera; binabaligtad ng transposisyon ang kumbensyong ito.

-c colormap
Gumamit ng color map colormap sa halip na ang default kulay-abo mapa ng kulay (isang grayscale na ramp
mula puti hanggang itim). colormap ay karaniwang pangalan ng isa sa mga mapa ng kulay
ibinigay sa h5topng (sa /usr/share/h5utils/colormaps na direktoryo), o maaari
sa halip ay ang pangalan ng isang color-map file.

Tatlong kapaki-pakinabang na kasama ang mga mapa ng kulay ay mainit (itim-pula-dilaw-puti, kapaki-pakinabang para sa
data ng intensity), Asul, pula (asul-puti-pula, kapaki-pakinabang para sa nilagdaang data), at hsv (a
maraming kulay na "bahaghari"). Kung gagamitin mo ang Asul, pula color map para sa nilagdaang data, maaari mong
gusto din gamitin ang -Z opsyon upang ang gitna ng sukat ng kulay (puti)
tumutugon sa zero.

Ang color-map file ay isang sequence ng whitespace-separated RGBA quadruples, kung saan
ang bawat halaga ay nasa hanay na 0.0 hanggang 1.0 at nagpapahiwatig ng bahagi ng
pula/berde/asul/alpha. (Ang alpha ng 0 ay transparent at ng 1 ay opaque; ito ay
ginagamit lamang para sa -a opsyon, sa ibaba.) Ang mga kulay sa color map ay linearly
interpolated kung kinakailangan upang magbigay ng tuluy-tuloy na color ramp.

-r Baligtarin ang pagkakasunod-sunod ng color map. Magagawa mo rin ito sa pamamagitan ng paglalagay ng a
"-" bago ang pangalan ng colormap sa -c or -a pagpipilian.

-Z Igitna ang sukat ng kulay sa halagang zero sa data.

-m minuto, -M max
Karaniwan, ang ibaba at itaas ng mapa ng kulay ay tumutugma sa minimum at maximum
mga halaga sa datos. Gamit ang mga opsyong ito, maaari mong gawin ang ibaba at itaas ng
kulay na mapa ay tumutugma sa minuto at max sa halip. Mga halaga ng data sa ibaba o sa itaas ng hanay na ito
ay tratuhin na parang sila minuto or max ayon sa pagkakabanggit. Tingnan din ang -Z at -R
mga pagpipilian.

-R Kapag maraming file ang tinukoy, itakda ang ibaba at itaas ng mga mapa ng kulay
ayon sa minimum at maximum sa lahat ng data. Ito ay kapaki-pakinabang upang iproseso
maraming mga file gamit ang isang pare-parehong sukat ng kulay, dahil kung hindi man ang sukat ay nakatakda para sa
bawat file nang paisa-isa.

-C file, -b Val
I-superimpose ang mga contour outline mula sa unang dataset sa file HDF5 file sa lahat ng
ang mga imahe ng output. (Kung ang contour dataset ay walang kaparehong dimensyon gaya ng
ang output data, ito ay pana-panahong "naka-tile" sa output.) Maaari mong gamitin ang
palaugnayan file:dataset upang tumukoy ng partikular na dataset sa loob ng file. Ang tabas
ang mga balangkas ay nasa paligid ng halaga ng Val (default sa gitna ng hanay ng halaga sa file).

-A file, -a colormap:kalabuan
Translucently overlay ang data mula sa unang dataset sa file HDF5 file, na
dapat magkaroon ng parehong mga dimensyon gaya ng input dataset, sa lahat ng output na larawan,
gamit ang colormap colormap na may opacity (mula sa 0 para sa ganap na transparent hanggang 1
para sa ganap na malabo) kalabuan pinarami ng mga opacity (alpha) na halaga sa
colormap. (Kung ang overlay na dataset ay walang parehong dimensyon gaya ng output
data, ito ay pana-panahong "naka-tile" sa output.) Maaari mong gamitin ang syntax
file:dataset upang tukuyin ang isang partikular na dataset sa loob ng file.

Ang ilang mga paunang-natukoy na colormap na partikular na gumagana para sa tampok na ito ay dilaw
(transparent na puti hanggang opaque yellow) kulay-abo (transparent na puti hanggang opaque black), yarg
(transparent na itim hanggang opaque na puti), berde (transparent na puti hanggang opaque green), at
Asul, pula (Opaque blue to transparent white to opaque red). Maaari mong ihanda ang "-" sa
ang pangalan ng colormap upang baligtarin ang pagkakasunud-sunod ng colormap. (Tingnan din -c, sa ibabaw ng
default para sa -a ay dilaw:0.3 (dilaw na colormap na pinarami ng 30% opacity).

-d pangalan
Gumamit ng dataset pangalan mula sa mga file ng pag-input; kung hindi, ang unang dataset mula sa bawat file
Ginagamit. Bilang kahalili, gamitin ang syntax HDF5FILE:DATASET, na nagbibigay-daan sa iyo
tumukoy ng ibang dataset para sa bawat file. Maaari mong gamitin ang h5ls utos (kasama
na may hdf5) upang mahanap ang mga pangalan ng mga dataset sa loob ng isang file.

-8 Gumamit ng 8-bit (na-index) na kulay para sa PNG na output, sa halip na 24-bit (direkta) na kulay (ang
default). (Pinaliit nito nang bahagya ang laki ng imahe, na may ilang pagkasira
kalidad.) Hindi suportado kasabay ng -A (translucent overlay) na opsyon.

Gamitin ang h5topng online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net