minclookup - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

minclookup - magsagawa ng mga conversion ng lookup table sa mga minc file

SINOPSIS

minclookup [ ] .mnc .mnc

DESCRIPTION

Minclookup gagawa ng isang lookup table operation sa bawat voxel ng isang minc file. Isang lookup
Ang talahanayan ay binubuo ng isang listahan ng mga halaga ng input na may katugmang mga halaga ng output. Ang bawat voxel ng
Ang input file ay matatagpuan sa lookup table at ang katumbas na halaga ng output ay nakasulat.
Ang mga output value na ito ay maaaring maging scalar o vector value kaya, halimbawa, isang color lookup
ang talahanayan ay magkakaroon ng apat na column: isang column para sa input value at isang column para sa bawat isa sa pula,
berde at asul na mga halaga ng output.

Ang mga talahanayan ng paghahanap ay maaaring tumagal ng isa sa dalawang anyo: walang patid or hiwalay.

Ang tuluy-tuloy na lookup table ay para sa pagtrato sa mga halaga ng voxel bilang tuluy-tuloy (tunay) na mga halaga at
pag-convert ng mga value sa pamamagitan ng paggawa ng interpolation sa pagitan ng mga value na ibinigay sa lookup table. A
tinatrato ng discrete lookup table ang mga value ng input bilang mga integer at tinatalakay ang mga ito bilang ganap
independiyenteng mga entry, na walang interpolation.

Ang pinakakaraniwang paggamit ng tuluy-tuloy na mga talahanayan ng paghahanap ay para sa pag-convert ng mga halaga ng intensity sa
Mga kulay ng RGB. Upang gawing mas simple ang mga lookup table, ang mga value ng input ay nire-rescale lahat sa
saklaw na zero hanggang isa. Bilang default, ang pinakamaliit na halaga sa file ay nagmamapa sa zero at ang pinakamalaki
mapa sa isa. Makikita ang value na ito sa lookup table, kadalasan sa pagitan ng dalawang entry sa
ang talahanayan (ang talahanayan ay palaging pinagsunod-sunod sa pataas na pagkakasunud-sunod ng mga halaga ng input). Linear
Ang interpolation ay tapos na sa bawat output column at ang resultang value (o values) ay
nakasulat sa output file. Kung mayroong higit sa isang halaga ng output sa bawat halaga ng input, kung gayon
ang dimensyon na vector_dimension ay idinagdag sa output file na may haba na katumbas ng numero
ng mga output column sa lookup table. Para sa mga halaga ng input sa labas ng hanay na zero hanggang isa, ang
pinakamalapit na halaga ng talahanayan ang ginagamit.

Karaniwang ginagamit ang mga discrete lookup table para sa muling pagmamapa ng mga value ng label. Ang bawat halaga ng input ay
itinuturing bilang isang integer (ito ay hindi rescaled) at kung ito ay matatagpuan sa lookup table, pagkatapos
ang katumbas na halaga (o mga halaga) ay nakasulat sa output file. Kung hindi ito matagpuan,
pagkatapos ay isang null na halaga ay nakasulat out (zero bilang default). Walang interpolation na ginagawa nang may discrete
lookup tables - para makakuha ng non-null output value, dapat mayroong entry sa table.

Opsyon

Tandaan na ang mga opsyon ay maaaring tukuyin sa pinaikling anyo (hangga't ang mga ito ay natatangi) at
maaaring ibigay kahit saan sa command line.

Pangkalahatan pagpipilian

-2 Gumawa ng MINC 2.0 na format na output file.

- clobber
I-overwrite ang isang umiiral na file.

-noclobber
Huwag i-overwrite ang isang umiiral na file (default).

-walang_clobber
kasingkahulugan ng -noclobber.

-salita
I-print ang impormasyon sa pag-unlad para sa bawat tipak ng data na nakopya (default).

-tahimik Huwag mag-print ng impormasyon sa pag-unlad.

-buffer_size laki
Tukuyin ang maximum na laki ng mga panloob na buffer (sa kbytes). Ang default ay 10 MB.

-type ng file
Lumikha ng isang output file na may parehong uri ng unang input file (default).

-byte Itabi ang bawat voxel bilang 8-bit integer.

-maikli Itabi ang bawat voxel bilang 16-bit integer.

-int Itabi ang bawat voxel bilang 32-bit integer.

-haba Pinalitan ng -int.

-lumutang Itabi ang bawat voxel sa 32-bit na floating point na format.

-doble
Itabi ang bawat voxel sa 64-bit na floating point na format.

-pinirmahan
Gumawa ng isang output file na may data na nakaimbak sa isang naka-sign na uri. Ang pagpipiliang ito ay walang kahulugan
kapag ginamit sa mga floating point na format ng data, na palaging nilagdaan.

-walang pirma
Lumikha ng isang output file na may data na nakaimbak sa isang unsigned na uri. Ang pagpipiliang ito ay
walang kabuluhan kapag ginamit sa mga floating point na format ng data.

-valid_range minuto max
I-scale ang mga halaga ng integer voxel upang mahulog sa pagitan ng mga halaga minuto at max. Bilang default
Ang mga halaga ng integer voxel ay i-scale upang magamit ang buong hanay ng uri ng base. Ito
Walang kabuluhan ang opsyon kapag ginamit sa mga format ng data ng floating point.

lookup mesa pagpipilian

-kulay-abo Gumamit ng gray na lookup table para isulat ang mga halaga ng RGB (default).

-kulay-abo kasingkahulugan ng -kulay-abo.

-mainit na bakal
Gumamit ng hot-metal lookup table para isulat ang mga halaga ng RGB.

- parang multo
Gumamit ng spectral (rainbow) lookup table upang isulat ang mga halaga ng RGB.

-baligtad
Baligtarin ang lookup table upang ang maximum na halaga ay mapa sa zero at ang minimum
mga mapa ng halaga sa isa. Nalalapat lamang sa tuluy-tuloy na lookup table.

-noinvert
Huwag baligtarin ang lookup table - ang pinakamababang mapa sa zero at ang maximum na mapa sa
isa (default).

-bago minuto max
Tukuyin ang hanay ng mga value na dapat imapa sa hanay ng lookup table
(Ang default ay ang buong hanay ng input file).

-minimum minuto
Tukuyin ang halaga ng input na nagmamapa sa pinakamababang halaga sa talahanayan ng paghahanap.

-maximum max
Tukuyin ang input value na nagmamapa sa maximum na value sa lookup table.

-lookup_table [file | -]
Tukuyin ang pangalan ng isang file na naglalaman ng lookup table. Kung - ay ibinigay, ang lookup
Ang talahanayan ay binabasa mula sa karaniwang input. Ang file ay dapat na may hindi bababa sa dalawang column: Ang
ang unang hanay ay nagbibigay ng mga halaga ng input; ang iba pang mga hanay ay nagbibigay ng katumbas
mga halaga ng output. Para sa tuluy-tuloy na lookup table, ang unang column ay dapat maglaman ng a
halaga sa pagitan ng zero at isang kasama ang mga tahasang entry para sa parehong zero at isa dapat
karaniwang ibinibigay. Para sa isang discrete lookup table, dapat maglaman ang unang column
mga halaga ng integer. Kung higit sa isang output column ang ibinigay, ang output file ay
may sukat vector_dimension na may haba na katumbas ng bilang ng output
mga hanay. Ang mga linya ng talahanayan ay pagbukud-bukurin kung kinakailangan upang ang una
ang hanay ay nasa pataas na ayos.

-lut_string lookup-table-string
Tukuyin ang kumpletong lookup table bilang isang string. Ang karakter na semicolon na ";"
ay ginagamit sa paghihiwalay ng mga linya.

-tuloy-tuloy
Ang talahanayan ng paghahanap ay tuloy-tuloy (tingnan ang paglalarawan sa itaas): Ang mga halaga ng input ay itinuturing bilang
tuluy-tuloy (tunay) na mga halaga at nire-rescale sa hanay na zero hanggang isa bago maging
tumingala; Ang interpolation ay ginagawa sa pagitan ng mga halaga sa talahanayan. Ito ang default
pag-uugali.

-discrete
Ang talahanayan ng paghahanap ay discrete (tingnan ang paglalarawan sa itaas): Ang mga halaga ng input ay itinuturing bilang
integer at walang interpolation na ginagawa sa pagitan ng mga halaga ng input.

-null_value null-value-string
Tumukoy ng null value na gagamitin sa mga discrete lookup table kapag ang value ay hindi
matatagpuan sa lookup table. Dapat na tukuyin ang halagang ito bilang isang listahang pinaghihiwalay ng kuwit
ng mga halaga, na may parehong bilang ng mga halaga gaya ng mga column ng output sa lookup table.

Panlahat pagpipilian para lahat utos:

-tulong I-print ang buod ng mga opsyon sa command-line at paglabas.

-version
I-print ang numero ng bersyon ng programa at lumabas.

HALIMBAWA

Upang makakuha ng mainit na metal na RGB na mga imahe mula sa isang MRI file:

minclookup -hotmetal input.mnc output.mnc

Upang i-convert ang mga label sa isang minc label file, gamitin ang -discrete:

minclookup -discrete -lookup_table lookupfile \
in_labels.mnc out_labels.mnc

kung saan ang lookupfile ay isang file na naglalaman ng mga entry para imapa ang label 2 hanggang 4 at label 3 hanggang 5:

2 4
3 5

Maaari mo ring tukuyin ang lookup table na ito sa command line:

minclookup -discrete -lut_string '2 4;3 5' \
in_labels.mnc out_labels.mnc

Para makakuha ng gray na RGB file, na may pula para sa mga value na mas mababa sa minimum at berde para sa mga value
mas malaki kaysa sa minimum, maaari kang magbigay ng dalawang zero na entry at dalawa sa isang entry. Ang una
zero ay ginagamit para sa mga negatibong halaga, ang pangalawang zero ay ginagamit para sa interpolation sa susunod
pagpasok. Walang kalabuan tungkol sa kung paano pangasiwaan ang isang halaga ng eksaktong zero dahil ang una
at ang mga huling halaga ng talahanayan ay pinangangasiwaan sa isang espesyal na paraan upang matiyak na ang mga ito
itinuturing na nasa loob ng saklaw kung ang ganitong uri ng dalawang-entry na sitwasyon ay nangyayari.

minclookup -lookup_table - input.mnc output.mnc <
0 1 0 0
0 0 0 0
1 1 1 1
1 0 1 0
EOF

Upang baligtarin ang isang scalar na imahe, maaari mong gamitin ang minclookup:

minclookup -lut_string '0 1;1 0' in.mnc out.mnc

Gumamit ng minclookup online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net