Ito ang command wossoutpute na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
wossoutput - Naghahanap ng mga programa sa pamamagitan ng EDAM output data
SINOPSIS
wossoutput -tagatukoy pisi [-pumutok boolean] [-showkeywords boolean]
-Sensitive boolean -mga subclass boolean -hindi na ginagamit boolean -emboss boolean
-embahada boolean -showembassy pisi - colon boolean -gui boolean
[-outfile outfile] [-html toggle] [-mga pangkat boolean] [-ng alpabeto boolean]
wossoutput -tulong
DESCRIPTION
wossoutput ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Ito ay bahagi ng (mga) command group na "Ontology:EDAM,Documentation."
Opsyon
input seksyon
-tagatukoy pisi
karagdagan seksyon
-pumutok boolean
Ang mga pangkat na kinabibilangan ng mga aplikasyon ng EMBOSS ay may dalawang anyo, sumabog at hindi
sumabog. Ang mga sumabog na pangalan ng grupo ay mas marami at kadalasang malabo ang pagkakasabi kaysa
yung hindi sumabog. Ang mga sumabog na pangalan ay nabuo mula sa mga kahulugan ng grupo
mga pangalan na nagsisimula tulad ng NAME1:NAME2 at pagkatapos ay pinalawak sa maraming kumbinasyon
ng mga pangalan bilang: 'NAME1', 'NAME2', 'NAME1 NAME2', NAME2 NAME1'. Ang mga hindi pinalawak na pangalan
ay tulad lang ng: 'NAME1 NAME2'. Default na halaga: N
-showkeywords boolean
Default na halaga: N
Advanced seksyon
-Sensitive boolean
Bilang default, ang mga keyword ng query ay itinutugma laban sa mga pangalan ng termino ng EDAM (at mga kasingkahulugan)
lamang. Ang pagpipiliang ito ay tumutugma din sa mga keyword laban sa mga kahulugan at kalooban ng termino ng EDAM
samakatuwid (karaniwang) mag-ulat ng higit pang mga tugma. Default na halaga: N
-mga subclass boolean
Palawakin ang mga tugma ng query upang maisama ang lahat ng mga termino na mga espesyalisasyon (EDAM
sub-class) ng katugmang uri. Default na halaga: Y
-hindi na ginagamit boolean
Ang default na gawi ay ang hindi gumamit o magbalik ng mga hindi na ginagamit na termino. Ang pagpipiliang ito kung nais itakda
isama ang lahat ng mga tuntunin. Default na halaga: N
-emboss boolean
Kung gagamitin mo ang opsyong ito, hahanapin ang dokumentasyon ng programa ng EMBOSS. Kung ito
ang opsyon ay nakatakdang maging false, pagkatapos ay ang mga programang EMBASSY lamang ang hahanapin (kung ang
-embassy option ay totoo). Ang mga programa ng EMBASSY ay hindi mahigpit na bahagi ng EMBOSS, ngunit ginagamit
ang parehong mga library ng code at may parehong hitsura at pakiramdam, ngunit sa pangkalahatan ay binuo
ng mga taong nagnanais na ang mga programa ay nasa labas ng GNU General Public License scheme
Default na halaga: Y
-embahada boolean
Kung gagamitin mo ang opsyong ito, hahanapin ang dokumentasyon ng programa ng EMBASSY. Kung ito
ang opsyon ay nakatakdang maging mali, pagkatapos ay ang mga programang EMBOSS lamang ang hahanapin (kung ang
-emboss na opsyon ay totoo). Ang mga programa ng EMBASSY ay hindi mahigpit na bahagi ng EMBOSS, ngunit gamitin ang
parehong mga library ng code at may parehong hitsura at pakiramdam, ngunit sa pangkalahatan ay binuo ni
mga taong nagnanais na ang mga programa ay nasa labas ng GNU General Public License scheme
Default na halaga: Y
-showembassy pisi
Kung gagamitin mo ang opsyong ito, magiging ang dokumentasyon ng programa ng package ng EMBASSY na ito
hinanap. Ang mga programa ng EMBASSY ay hindi mahigpit na bahagi ng EMBOSS, ngunit gumagamit ng parehong code
mga aklatan at magkapareho ang hitsura at pakiramdam, ngunit sa pangkalahatan ay binuo ng mga taong
sana ang mga programa ay nasa labas ng GNU General Public License scheme
- colon boolean
Ang mga pangkat na kinabibilangan ng mga EMBOSS application ay hanggang sa dalawang antas, halimbawa ang
Ang pangunahing pangkat na 'ALIGNMENT' ay may ilang mga sub-grupo, o pangalawang antas na mga pangkat, hal:
CONSENSUS, DIFFERENCES, DOT PLOTS, GLOBAL, LOCAL, MULTIPLE. Upang tulungan ang mga programang nag-parse
ang output ng wossname na nangangailangan ng mga pangalan ng mga subgroup na ito, ang magiging colon na ':'
inilagay sa pagitan ng una at ikalawang antas ng pangalan ng grupo kung totoo ang opsyong ito.
Tandaan: Hindi ito nalalapat kung ang mga pangalan ng grupo ay sumabog na may 'sumabog'
opsyon. Default na halaga: N
-gui boolean
Ang pagpipiliang ito ay inilaan upang matulungan ang mga taong nagdidisenyo ng Mga Graphical na Interface ng User
ang mga aplikasyon ng EMBOSS. Ang ilang EMBOSS program ay hindi angkop para sa pagtakbo sa isang GUI,
kabilang dito ang iba pang mga menu program at interactive na editor. Ang pagpipiliang ito ay nagpapahintulot sa iyo na
iulat lamang ang mga programang iyon na maaaring patakbuhin mula sa isang GUI Default na halaga: N
Pagbubuhos seksyon
-outfile outfile
Default na halaga: stdout
Html seksyon
-html toggle
Kung ipinapadala mo ang output sa isang file, i-format ito para ipakita bilang isang talahanayan
sa isang dokumento sa WWW. Default na halaga: N
-mga pangkat boolean
Kung gagamitin mo ang opsyong ito, ang mga pangalan lang ng grupo ang ilalabas sa Default ng file
halaga: N
-ng alpabeto boolean
Kung gagamitin mo ang opsyong ito, makakakuha ka ng isang listahan ng mga pangalan ng program at
paglalarawan sa halip na ang mga program na nakalista sa kanilang mga functional na grupo. Default
halaga: N
Gumamit ng wossoutpute online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
