Ito ang Linux app na pinangalanang bspipe na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang bspipe-1.3.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang bspipe sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
bspipe
Ad
DESCRIPTION
Ang BSpipe ay isang komprehensibong pipeline mula sa sequence quality control at pagmamapa hanggang sa functional analysis ng differentially methylated na mga rehiyon:
(1) sequencing ng pagtatasa ng kalidad,
(2) pagkakasunod-sunod ng paglilinis,
(3) sequence read mapping,
(4) dami ng methylation,
(4) sample na paghahambing batay sa methylation profile,
(5) pagkilala sa mga DMR (differentially methylated regions),
(6) anotasyon ng mga DMR,
(7) functional analysis ng differentially methylated genes,
(8) pagbuo ng mga input file para sa visualization, at
(9) suporta para sa mga advanced na teknolohiya sa sequencing tulad ng TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it, at NOMe-seq.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Unix Shell, Perl, S/R
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
