Ito ang Linux app na pinangalanang ChIP-RNA-seqPRO na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang cloudclientID.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang ChIP-RNA-seqPRO upang tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Ang ChIP-RNA-seqPRO ay tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
ChIP-RNA-seqPRO: Isang diskarte para sa pagtukoy ng mga rehiyon ng epigenetic deregulation na nauugnay sa aberrant transcript splicing at RNA-editing site. Runnable na mga script ng python na naka-package kasama ng mga customized na annotation library, demo data input at README guide.9/26 : v1.1 Na-update ang MAIN_IV upang i-debug ang error na itinapon ng mga python pandas na hindi na sumusuporta sa 'subset'.
Ang code na ito ay hindi na aktibong pananatilihin/ia-update dito. Available na ngayon ang isang cloud-based na resource para sa comparative analysis ng epigenetic, sequence variation, at expression datasets. Pakibisita ang Cloudomics, proyekto para sa cloud-based na mga mapagkukunan: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Mga tampok
- Tool para sa comparative analysis ng malawak na iba't ibang epigenomic (ChIPseq, MBDseq, atbp.) at RNA-based sequencing paired sample datasets
- Kung gagamitin mo ang tool na ito o alinman sa mga library ng anotasyon mangyaring isama ang sumusunod na sanggunian: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. at H. Ho T. (2015). Mga Istratehiya ng Bioinformatics para sa Pagtukoy ng mga Rehiyon ng Epigenetic Deregulation na Nauugnay sa Aberrant Transcript Splicing at RNA-editing. Sa Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, pahina 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Unix Shell, Python
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
