Ito ang Linux app na pinangalanang CStone na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang cstone.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang CStone na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
CStone
DESCRIPTION
Ang CStone ay isang de novo assembler para sa RNA-Seq data na gumagamit ng de Bruijn tulad ng mga graph at nag-annotate sa bawat contig na ginawa gamit ang isa sa tatlong antas ng pag-uuri ng graph na nagsasaad kung ito ay magagarantiyahan na hindi chimeric o hindi. Ang mga antas ng pag-uuri ay nakasalalay sa pagiging kumplikado ng pamilya ng gene kung saan nagmula ang mga nabasa. Bilang isang by-product, nagbibigay din ito ng insight sa structural makeup ng pinagbabatayan na mga pamilya ng gene na na-sequence. Ang karagdagang mga detalye ay makukuha sa loob ng aming papel: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Mga tampok
- De novo assembly ng RNA-Seq data.
- Pagkilala sa mga non-chimeric contigs.
- Cross-platform compatibility.
- Available ang executable jar.
- Walang kinakailangang mga panlabas na pakete.
- Madaling sundin ang code at isinama sa iba pang mga tool.
- Impormasyon sa pagiging kumplikado ng pinagbabatayan ng mga pamilya ng gene.
- de Bruijn tulad ng (mas maluwag) na diskarte.
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/cstone/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
