Ito ang Linux app na pinangalanang EXCAVATOR-tool upang tumakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang EXCAVATOR-tool upang tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
EXCAVATOR-tool upang tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
ATTENTION!!!!!ATTENTION!!!!!ATTENTION!!!!!ATTENTION!!!!!Kamakailan ay nai-publish namin sa BMC Genomics ang isang nobelang software package, pinangalanang XCAVATOR, para sa pagkilala sa mga CNV/CNA mula sa maikli at mahabang reads na whole-genome sequencing na mga eksperimento (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
Ang XCAVATOR ay malayang magagamit sa http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
Ang EXCAVATOR ay isang nobelang software package para sa pag-detect ng mga copy number variants (CNV) mula sa whole-exome sequencing data.
EXCAVATOR ay nai-publish sa Genome Biology (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
########################
PANSIN!!!!! Upang magamit nang maayos ang EXCAVATOR tool, dapat i-download ng mga user ang uniqueome mappability file sa sumusunod na link:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (para sa hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
Mga tampok
- Pagsunud-sunod ng Susunod na Henerasyon
- Kopyahin ang Mga Variant ng Numero
- Buong Exome Sequencing
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/excavatortool/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.