Ito ang Linux app na pinangalanang FamSeq na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang FamSeq1.0.2.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang FamSeq na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
FamSeq
Ad
DESCRIPTION
Mahirap pa ring tawagan ang mga bihirang variant. Sa family-based sequencing studies, ang impormasyon mula sa lahat ng miyembro ng pamilya ay dapat gamitin para mas tumpak na matukoy ang mga bagong germline mutations. Ang FamSeq ay nagsisilbi sa layuning ito sa pamamagitan ng pagbibigay ng posibilidad na ang isang indibidwal ay may dalang variant na ibinigay sa hilaw na sukat ng kanyang buong pamilya. Ang FamSeq ay tinatanggap ang mga de novo mutations at maaaring magsagawa ng variant na pagtawag sa chromosome X.
Upang matugunan ang mga variation sa pagiging kumplikado ng data, ang FamSeq ay binubuo ng tatlong natatanging pagpapatupad ng Mendelian genetic model: ang Bayesian network algorithm, Elston-Stewart algorithm at Markov chain Monte Carlo algorithm. Upang gawing mahusay at naaangkop ang software sa malalaking pamilya, pinagkatulad namin ang algorithm ng Bayesian network na humaharap sa mga pedigree na may mga inbreeding loop nang hindi nawawala ang katumpakan ng pagkalkula sa isang NVIDIA® graphics processing unit.
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
C + +
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/famseq/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
